273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0588 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  100 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  98.38 
 
 		 185 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  98.38 
 
 		 185 aa  363  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  97.84 
 
 		 185 aa  353  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  97.3 
 
 		 185 aa  352  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  69.78 
 
 		 187 aa  256  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  70.51 
 
 		 180 aa  204  7e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  70.51 
 
 		 180 aa  204  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  70.51 
 
 		 180 aa  204  7e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  70.51 
 
 		 180 aa  204  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  70.51 
 
 		 180 aa  204  7e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  70.51 
 
 		 180 aa  204  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  70.51 
 
 		 180 aa  204  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  70.51 
 
 		 180 aa  204  7e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  50.8 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  50 
 
 		 184 aa  151  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  54.78 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  55.06 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  49.36 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  49.36 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  54.14 
 
 		 182 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  54.14 
 
 		 182 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  54.14 
 
 		 182 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  40.52 
 
 		 170 aa  104  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  32.53 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0589  fimbrial protein internal segment  34.59 
 
 		 164 aa  98.2  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0147243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0590  fimbrial protein internal segment  34.59 
 
 		 164 aa  98.2  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0238251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  32.62 
 
 		 179 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  32.62 
 
 		 179 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  39.22 
 
 		 174 aa  97.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  32.62 
 
 		 179 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  32.62 
 
 		 179 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0654  fimbrial protein internal segment  33.96 
 
 		 164 aa  97.4  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.781355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0597  fimbrial protein internal segment  33.96 
 
 		 164 aa  97.4  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0916045 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  37.25 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0988  fimbrial protein  33.12 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.991205  normal  0.0750747 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  31.33 
 
 		 165 aa  96.3  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  36.36 
 
 		 174 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  36.36 
 
 		 174 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  39.87 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  39.87 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  36.36 
 
 		 174 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  39.87 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  39.22 
 
 		 170 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  39.22 
 
 		 170 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  32.23 
 
 		 200 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  31.93 
 
 		 165 aa  94.7  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01468  predicted transcriptional regulator  46.72 
 
 		 178 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  36.76 
 
 		 173 aa  91.7  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  37.25 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  37.25 
 
 		 170 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  37.25 
 
 		 170 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  37.25 
 
 		 170 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  35.06 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  35.06 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  35.06 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  35.06 
 
 		 168 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  35.06 
 
 		 168 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  34.46 
 
 		 172 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  34.46 
 
 		 172 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  34.46 
 
 		 172 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  34.46 
 
 		 172 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  37.01 
 
 		 174 aa  85.1  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  34.65 
 
 		 190 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  35.71 
 
 		 176 aa  84.3  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  34.16 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  34.76 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  34.16 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  35.45 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  33.51 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  33.51 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  33.33 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  33.51 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  33.51 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  33.69 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  33.69 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  31.38 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  31.38 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  31.38 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  33.69 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  33.69 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  33.69 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  33.96 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  32.97 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  34.02 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  33.69 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  38.06 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  38.06 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  38.06 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  38.06 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  38.06 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  33.16 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  33.16 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  33.99 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  33.99 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  33.99 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  32.8 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  33.99 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  33.99 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  33.99 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>