282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1601 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  100 
 
 
170 aa  340  7e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  100 
 
 
170 aa  340  7e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  100 
 
 
170 aa  340  7e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  97.65 
 
 
170 aa  309  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  97.65 
 
 
170 aa  309  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  81.76 
 
 
210 aa  284  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  81.76 
 
 
170 aa  283  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  81.76 
 
 
170 aa  283  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  81.76 
 
 
170 aa  283  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  83.91 
 
 
174 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  81.76 
 
 
170 aa  255  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  42.53 
 
 
173 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  44.09 
 
 
184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  45.7 
 
 
187 aa  112  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  45.7 
 
 
187 aa  112  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  45.75 
 
 
182 aa  111  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  39.89 
 
 
183 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  44.81 
 
 
182 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  44.81 
 
 
182 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  44.81 
 
 
182 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  44.81 
 
 
182 aa  100  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  40.52 
 
 
185 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  38.86 
 
 
174 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  37.85 
 
 
176 aa  97.4  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  39.87 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  37.85 
 
 
176 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  37.91 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  37.85 
 
 
176 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  37.85 
 
 
176 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  37.85 
 
 
176 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  38.29 
 
 
174 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  38.29 
 
 
174 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  39.87 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  38.29 
 
 
174 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  38.07 
 
 
174 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  37.08 
 
 
179 aa  90.1  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  40.52 
 
 
185 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  40.52 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  37.43 
 
 
187 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  38.04 
 
 
180 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  38.04 
 
 
180 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  38.04 
 
 
180 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  38.04 
 
 
180 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  39.33 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  35.76 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  31.18 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  31.18 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  31.18 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  32 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  31.18 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  31.33 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  34.39 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  31.33 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  35.59 
 
 
177 aa  77.4  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  37.87 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  37.87 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  37.87 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  38.99 
 
 
193 aa  77  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4675  fimbrial protein  30.18 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.89 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  31.89 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  31.89 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3982  protein LpfE  34.25 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567222  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  36.25 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  31.89 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  32.12 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.167394 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  32.12 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  32.12 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  32.12 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  35.26 
 
 
190 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  33.87 
 
 
183 aa  73.9  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  31.52 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  35.62 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  31.89 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  35.62 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  35.62 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  34.74 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  35.62 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  35.62 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  35.62 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  35.62 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  34.74 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  32 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  32 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  32 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  32 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  31.43 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  31.07 
 
 
179 aa  70.9  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  29.83 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01468  predicted transcriptional regulator  41.8 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  30.73 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  31.66 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0556  fimbrial protein  32.99 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03009  predicted fimbrial-like adhesin protein  32.99 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3624  fimbrial protein  32.97 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2380  fimbrial protein  30.6 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02960  hypothetical protein  32.99 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3334  putative type 1 fimbrial protein  32.99 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.370999  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1053  fimbrial protein  30.6 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.165848  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4107  fimbrial protein  34.78 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>