101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3982 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3982  protein LpfE  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567222  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3914  hypothetical protein  52.33 
 
 		 175 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3958  hypothetical protein  52.33 
 
 		 175 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3849  protein LpfE  52.33 
 
 		 175 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551931  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4018  hypothetical protein  52.33 
 
 		 175 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4917  protein LpfE  45.73 
 
 		 176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  34.25 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  34.25 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  34.25 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  32.6 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  32.6 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  32.6 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  33.15 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  34.25 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  34.25 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  34.25 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  34.25 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  33.53 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  32.28 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  32.12 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  32.12 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  32.94 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  30.05 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  30.05 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  30.38 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  29.53 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  27.17 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  28.39 
 
 		 187 aa  51.6  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2279  Fimbrial protein  31.85 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  29.24 
 
 		 175 aa  51.6  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  32.22 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  29.35 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  29.07 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  29.07 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  29.07 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  26.23 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  28.42 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  28.73 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  28.73 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  31.45 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  31.45 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  28.73 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  31.45 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  31.45 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  31.45 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  28.73 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  27.08 
 
 		 355 aa  48.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  27.6 
 
 		 179 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  27.56 
 
 		 172 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  27.56 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  27.56 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  27.56 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  27.56 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  27.81 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  27.56 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  25.44 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5940  fimbrial protein  27.86 
 
 		 335 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  24.71 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  24.55 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3836  fimbrial protein-like protein  27.98 
 
 		 362 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38252  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  28.85 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  26.28 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  26.28 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  26.28 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  26.28 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  24.55 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  24.55 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  28.28 
 
 		 305 aa  45.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  24.55 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  38.95 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  28.85 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  24.55 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  24.7 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  27.74 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  25 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  25.97 
 
 		 177 aa  44.3  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  26.49 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  28.34 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  28.34 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  28.21 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11110  fimbrial protein cupB6  25.93 
 
 		 381 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2785  fimbrial protein  25.87 
 
 		 317 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.971875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  27.51 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  30.43 
 
 		 182 aa  42  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  25.99 
 
 		 171 aa  41.6  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  25.99 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.42 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  28.42 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  25.99 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  28.42 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  28.42 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  25.99 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  26.74 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  23.2 
 
 		 195 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  25.99 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  28.42 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0563  Fimbrial protein  29.15 
 
 		 194 aa  41.2  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2492  putative minor fimbrial subunit  31.58 
 
 		 174 aa  41.2  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000455389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  32.58 
 
 		 173 aa  41.2  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  28.42 
 
 		 183 aa  41.2  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>