171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02915 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  100 
 
 
183 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  100 
 
 
183 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  100 
 
 
183 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  99.45 
 
 
183 aa  374  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  100 
 
 
183 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  37.43 
 
 
188 aa  105  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  37.97 
 
 
188 aa  104  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  37.43 
 
 
188 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  37.43 
 
 
188 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  37.43 
 
 
188 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  36.9 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4107  fimbrial protein  36.6 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4167  fimbrial protein  36.08 
 
 
185 aa  95.1  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208519 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0051  fimbrial protein  36.08 
 
 
185 aa  95.5  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  34.21 
 
 
179 aa  89  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  32.04 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  35.33 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  36.56 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  36.65 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  35.11 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  30.3 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  35.16 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  33.69 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  31.18 
 
 
174 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  29.84 
 
 
193 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  30.27 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  30.27 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  30.27 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  33.51 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  33.51 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  33.51 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  29.85 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  33.33 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  29.59 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  29.59 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  27.23 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  30.17 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  32.8 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  32.8 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  30.17 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  34.73 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  32.8 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  32.8 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  30.17 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  30.17 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  33.73 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3481  fimbrial protein  27.46 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  29.61 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  29.57 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  29.57 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  32.97 
 
 
170 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  32.97 
 
 
170 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  32.97 
 
 
170 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  30.65 
 
 
185 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  30.12 
 
 
185 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  37.84 
 
 
182 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  37.84 
 
 
182 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  37.84 
 
 
182 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2497  fimbrial protein  33.33 
 
 
188 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  30.11 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  26.11 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  25.48 
 
 
165 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  25.48 
 
 
179 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  25.48 
 
 
179 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  25.48 
 
 
179 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  25.48 
 
 
179 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  28.26 
 
 
190 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  25.48 
 
 
165 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  27.72 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0408  fimbrial protein  26.49 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  36.94 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  27.72 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4147  fimbrial protein  25 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  32.93 
 
 
170 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2490  fimbrial protein  28.27 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  32.28 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2634  fimbrial protein  28.27 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  32.93 
 
 
170 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  32.28 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.515875 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02263  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.27 
 
 
187 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1318  Fimbrial protein  28.27 
 
 
187 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02224  hypothetical protein  28.27 
 
 
187 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1314  fimbrial protein  27.75 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  35.14 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4139  fimbrial protein  32.35 
 
 
180 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274717  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4724  fimbrial protein  26.09 
 
 
181 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0545532  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  36 
 
 
173 aa  52.4  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0214  putative fimbrial subunit  27.54 
 
 
186 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0216  putative fimbrial subunit  27.54 
 
 
186 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.17546  normal  0.944353 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  28.82 
 
 
175 aa  51.2  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0231  putative fimbrial subunit  27.54 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157233  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0232  putative fimbrial subunit  27.54 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69001  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  27.07 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  26.52 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4717  fimbrial protein  28.72 
 
 
180 aa  49.3  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0885059  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  26.74 
 
 
180 aa  49.3  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.45 
 
 
180 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  26.63 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  29.45 
 
 
180 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>