76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4147 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4147  fimbrial protein  100 
 
 		 180 aa  368  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4724  fimbrial protein  59.76 
 
 		 181 aa  217  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0545532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0402  fimbrial protein  37.43 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  30.11 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  33.15 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  29.24 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  29.24 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  28.99 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  28.24 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  27.49 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  26.82 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  29.05 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  26.82 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  26.82 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  26.82 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  26.82 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  25 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  25 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  25 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  25 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  25 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  25 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  28.19 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  27.39 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  28.49 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  28.49 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  28.49 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  26.32 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  26.11 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  26.11 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  26.11 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  26.11 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  26.2 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  26.2 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  26.2 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  25.56 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  25.56 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  25.67 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  25.56 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  24.86 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2227  fimbrial protein, putative  26.09 
 
 		 370 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0719141  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  30.97 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  27.52 
 
 		 173 aa  47.8  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  25.56 
 
 		 174 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  26.45 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  25.3 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  24.71 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  24.43 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  24.54 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  26.67 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0408  fimbrial protein  21.28 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  23.37 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  23.37 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  23.37 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  25.54 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  37.18 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  37.18 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  23.37 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  37.18 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  24.85 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4721  fimbrial protein  29.27 
 
 		 220 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.687124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  27.36 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  22.98 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  31.13 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  22.98 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  22.98 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  22.98 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  31.71 
 
 		 184 aa  42  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  29.27 
 
 		 182 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  22.83 
 
 		 181 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  35.71 
 
 		 184 aa  41.2  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  22.98 
 
 		 171 aa  41.2  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0597  fimbrial protein internal segment  22.62 
 
 		 164 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0916045 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0654  fimbrial protein internal segment  22.62 
 
 		 164 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.781355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0051  fimbrial protein  20.86 
 
 		 185 aa  40.8  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4167  fimbrial protein  20.86 
 
 		 185 aa  40.8  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>