178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0054 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  100 
 
 
184 aa  371  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  91.85 
 
 
184 aa  343  6e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  52.22 
 
 
173 aa  166  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  59.12 
 
 
179 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  47.51 
 
 
175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  45.5 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  49.69 
 
 
182 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  43.75 
 
 
180 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  43.75 
 
 
180 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  43.23 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  38.27 
 
 
183 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  43.81 
 
 
186 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  41.57 
 
 
182 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  39.67 
 
 
185 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  38.8 
 
 
186 aa  97.8  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  39.39 
 
 
182 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  39.05 
 
 
186 aa  88.6  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  36.42 
 
 
181 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  36.42 
 
 
181 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  36.42 
 
 
169 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  36.65 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  33.66 
 
 
195 aa  82  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  35.23 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  35.23 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  35.23 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  35.23 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  35.23 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  34.97 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  35.29 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  34.97 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  34.97 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  31.79 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  36.31 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  36.31 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  36.31 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1694  fimbrial protein  43.54 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857438  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  36.07 
 
 
180 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  34.55 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  31.28 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  31.28 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  41.67 
 
 
183 aa  72  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  37.78 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  31.06 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  34.2 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  31.37 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.12656 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  31.95 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  31.95 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  31.95 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  31.95 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  32.54 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  31.95 
 
 
176 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  31.36 
 
 
176 aa  62.8  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  31.95 
 
 
176 aa  62  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  29.8 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  29.8 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  29.8 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  30.91 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.244383 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  29.8 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  30 
 
 
182 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  34.43 
 
 
183 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  28.11 
 
 
190 aa  57.8  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  28.11 
 
 
190 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  27.92 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  27.92 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  29.74 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  27.92 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  32.91 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  27.92 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  32.73 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  28.48 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  27.57 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.161781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  32.28 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  32.28 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  32.28 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  32.28 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  28.4 
 
 
165 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  28.4 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  27.78 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  29.41 
 
 
174 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0298  fimbrial protein  33.96 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  37.04 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  32.28 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3023  fimbrial subunit CupA1  31.22 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  31.18 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  31.18 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  31.18 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  33.33 
 
 
182 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  33.33 
 
 
182 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  31.41 
 
 
182 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  28.65 
 
 
180 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.92 
 
 
171 aa  52  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  30.92 
 
 
171 aa  52  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  30.92 
 
 
171 aa  52  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  30.92 
 
 
171 aa  52  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  30.19 
 
 
193 aa  51.6  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2870  fimbrial protein  28.22 
 
 
202 aa  51.2  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  30.26 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1532  fimbrial protein  29.06 
 
 
194 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.690066 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2380  fimbrial protein  32.69 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>