168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B3185 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  100 
 
 
196 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  86.73 
 
 
193 aa  336  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  86.22 
 
 
193 aa  334  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  84.5 
 
 
193 aa  329  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  83.25 
 
 
195 aa  327  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4107  fimbrial protein  35.9 
 
 
185 aa  92.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4167  fimbrial protein  35.38 
 
 
185 aa  88.2  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208519 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0051  fimbrial protein  35.38 
 
 
185 aa  88.2  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  34.94 
 
 
176 aa  84  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  32.84 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  32.84 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  32.84 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  32.84 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  32.99 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  31.86 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  34.52 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  32.14 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  32.14 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  32.14 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.63 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  31.98 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  30.58 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0138802 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.85 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  29.85 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  29.85 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  29.85 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  32.34 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  29.85 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  29.85 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  30.1 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  30.46 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  32.34 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  30.61 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4147  fimbrial protein  28.99 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  29.08 
 
 
174 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  30.1 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  30.1 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  30.1 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  30.1 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  30.1 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  28.66 
 
 
179 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  28.66 
 
 
179 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  28.66 
 
 
179 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  28.66 
 
 
179 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  28.66 
 
 
165 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  30 
 
 
176 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  30 
 
 
176 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  30 
 
 
176 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  30 
 
 
176 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  30 
 
 
176 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  28.66 
 
 
165 aa  61.2  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  30.85 
 
 
176 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  30.85 
 
 
176 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  30.85 
 
 
176 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  30 
 
 
176 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  28.66 
 
 
165 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0402  fimbrial protein  29.8 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  30 
 
 
176 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  29.85 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  32.53 
 
 
176 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  33.13 
 
 
175 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  26.77 
 
 
171 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  26.77 
 
 
171 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  26.77 
 
 
171 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  26.77 
 
 
171 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  26.77 
 
 
187 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  29.61 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0822  Fimbrial protein  29.27 
 
 
189 aa  58.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2227  fimbrial protein, putative  27.84 
 
 
370 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0719141  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.18 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  29.12 
 
 
176 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  29.12 
 
 
176 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  27.18 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  28.57 
 
 
182 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4724  fimbrial protein  27.54 
 
 
181 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0545532  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  29.12 
 
 
176 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  29.12 
 
 
176 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  29.12 
 
 
176 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  27.18 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  27.18 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1057  Fimbrial protein  27.81 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  26.77 
 
 
171 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  26.67 
 
 
171 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1068  fimbrial protein  29.8 
 
 
183 aa  55.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  28.36 
 
 
187 aa  55.1  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  28.1 
 
 
185 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  26.77 
 
 
171 aa  54.7  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  30.23 
 
 
170 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  30 
 
 
183 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0231  putative fimbrial subunit  28.25 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157233  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0232  putative fimbrial subunit  28.25 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69001  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  26.67 
 
 
170 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  30.06 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  27.78 
 
 
171 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  27.78 
 
 
171 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  27.78 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  27.78 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  27.78 
 
 
171 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  26.67 
 
 
170 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2497  fimbrial protein  41.67 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>