171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2917 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  100 
 
 		 188 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  79.26 
 
 		 188 aa  311  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  79.26 
 
 		 188 aa  311  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  79.26 
 
 		 188 aa  311  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  79.26 
 
 		 188 aa  311  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  78.19 
 
 		 188 aa  308  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  38.5 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  37.97 
 
 		 183 aa  104  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  37.97 
 
 		 183 aa  104  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  37.97 
 
 		 183 aa  104  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  37.97 
 
 		 183 aa  104  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  37.97 
 
 		 183 aa  104  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00668  hypothetical protein  92.16 
 
 		 51 aa  101  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4107  fimbrial protein  38.95 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0051  fimbrial protein  38.59 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4167  fimbrial protein  38.59 
 
 		 185 aa  92.4  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  33.16 
 
 		 195 aa  80.9  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  35.29 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  33.51 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  33.51 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  32.31 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  28.66 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  31.52 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  36.84 
 
 		 182 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  36.84 
 
 		 182 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  36.84 
 
 		 182 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  31.29 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  30.77 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  31.98 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  30.98 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  30.98 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  30.98 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  30.98 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  30.63 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  30.63 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  33.12 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  33.59 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  31.25 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  31.25 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  31.25 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.49 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  28.49 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  28.49 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  28.49 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  27.96 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  31.01 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  29.19 
 
 		 176 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  29.19 
 
 		 176 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  29.19 
 
 		 176 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  26.84 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  30.27 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  29.85 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4724  fimbrial protein  30 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0545532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  26.98 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  32.14 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  25.41 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0408  fimbrial protein  24.6 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  28.49 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4147  fimbrial protein  28.19 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  27.72 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  27.72 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  27.72 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0232  putative fimbrial subunit  25.73 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69001  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0231  putative fimbrial subunit  25.73 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  28.73 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03009  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.27 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3334  putative type 1 fimbrial protein  29.27 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.370999  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02960  hypothetical protein  29.27 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0556  fimbrial protein  29.27 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0214  putative fimbrial subunit  25.73 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0216  putative fimbrial subunit  25.73 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.17546  normal  0.944353 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  30.48 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  29.05 
 
 		 172 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  30.48 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  25.42 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  25.42 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  25.42 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0988  fimbrial protein  26.22 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.991205  normal  0.0750747 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  25.42 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2279  Fimbrial protein  26.52 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3624  fimbrial protein  28.78 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0402  fimbrial protein  29.33 
 
 		 186 aa  51.2  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  29.95 
 
 		 175 aa  51.2  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  28.75 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4460  putative type 1 fimbrial protein  28.42 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  25.71 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0563  Fimbrial protein  28.42 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  25.71 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  25.71 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  26.42 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  26.42 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  25.71 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  26.42 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  25.71 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  26.42 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  26.29 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  29.09 
 
 		 170 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  26.7 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  26.7 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  26.25 
 
 		 176 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>