140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0563 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0563  Fimbrial protein  100 
 
 		 194 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03009  predicted fimbrial-like adhesin protein  95.36 
 
 		 194 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02960  hypothetical protein  95.36 
 
 		 194 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3334  putative type 1 fimbrial protein  95.36 
 
 		 194 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.370999  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3624  fimbrial protein  94.33 
 
 		 194 aa  378  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0556  fimbrial protein  95.36 
 
 		 194 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4460  putative type 1 fimbrial protein  94.33 
 
 		 194 aa  377  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  31.61 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.61 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  31.82 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.09 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  31.44 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  31.44 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  31.44 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  28.86 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  32.47 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  29.41 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  29.79 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  31.96 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  31.96 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  31.96 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  28.36 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  31.07 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  31.07 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  31.07 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  31.03 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  31.03 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  28.82 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  28 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  28 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  28 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  28 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  33.06 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  32.43 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  28.81 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  29.93 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  29.93 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  29.94 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  30.88 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  31.15 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  28.25 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  30.88 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  30.88 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  30.88 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2448  fimbrial protein  29.21 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  28.65 
 
 		 175 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  27.01 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  30 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  28.25 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  26.74 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  26.74 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  26.74 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  26.74 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2227  fimbrial protein, putative  27.11 
 
 		 370 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0719141  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  30.15 
 
 		 181 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  26.74 
 
 		 176 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  26.2 
 
 		 176 aa  51.6  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  28.42 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  26.74 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.18 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2634  fimbrial protein  38.55 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  26.2 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  32.05 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  41.67 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  41.67 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  41.67 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  29.7 
 
 		 306 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  41.67 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  41.67 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  41.67 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  41.67 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  41.67 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  25.95 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2490  fimbrial protein  39.76 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  25.95 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1314  fimbrial protein  39.76 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  25.95 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02263  predicted fimbrial-like adhesin protein  38.55 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  28 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  28 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1318  Fimbrial protein  38.55 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  28 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  28 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02224  hypothetical protein  38.55 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  28 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1454  fimbrial protein  26.47 
 
 		 360 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118343 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  28 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  27.57 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  27.57 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  27.57 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  27.57 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2036  fimbrial protein  27.03 
 
 		 371 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  26.63 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0589  fimbrial protein internal segment  22.54 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0147243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0590  fimbrial protein internal segment  22.54 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0238251  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  32.05 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0597  fimbrial protein internal segment  21.97 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0916045 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0654  fimbrial protein internal segment  21.97 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.781355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  27.27 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  27.27 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>