85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1314 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2490  fimbrial protein  98.93 
 
 		 187 aa  376  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1314  fimbrial protein  100 
 
 		 187 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02263  predicted fimbrial-like adhesin protein  98.4 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2634  fimbrial protein  98.4 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1318  Fimbrial protein  98.4 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02224  hypothetical protein  98.4 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3481  fimbrial protein  88.77 
 
 		 187 aa  319  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2497  fimbrial protein  70.37 
 
 		 188 aa  259  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0216  putative fimbrial subunit  37.85 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.17546  normal  0.944353 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0214  putative fimbrial subunit  37.85 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0232  putative fimbrial subunit  37.85 
 
 		 186 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69001  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0231  putative fimbrial subunit  37.85 
 
 		 186 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3088  putative fimbrial subunit  36.27 
 
 		 195 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3152  putative fimbrial subunit  36.27 
 
 		 195 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156636 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3171  putative fimbrial subunit  36.27 
 
 		 195 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.320855  normal  0.326781 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3269  putative fimbrial subunit  36.27 
 
 		 195 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0251275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  30.37 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  29.29 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  30.85 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  32.08 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  28.57 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  28.57 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  28.57 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  28.57 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  30.73 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  28.57 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  30.49 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  28.5 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  28.5 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  28.5 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.608236 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.5 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  28.5 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  28.5 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  29.52 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  29.57 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  30.41 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  29 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  29.7 
 
 		 193 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4675  fimbrial protein  33.78 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  26.84 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  29.82 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  29.82 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  29.82 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0563  Fimbrial protein  39.76 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4460  putative type 1 fimbrial protein  38.55 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  28.65 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  29.03 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  28.26 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3624  fimbrial protein  37.35 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4717  fimbrial protein  26 
 
 		 180 aa  45.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0885059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4139  fimbrial protein  25.16 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274717  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  24.47 
 
 		 188 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  26.35 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0556  fimbrial protein  37.35 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02960  hypothetical protein  37.35 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  26.35 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  26.35 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  26.35 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03009  predicted fimbrial-like adhesin protein  37.35 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  25.26 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  26.88 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3334  putative type 1 fimbrial protein  37.35 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.370999  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4721  fimbrial protein  32.76 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.687124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  26.88 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  26.35 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  26.35 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  34.65 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3093  fimbrial subunit  26.32 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  34.65 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  27.92 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  34.65 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  27.03 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0988  fimbrial protein  21.21 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.991205  normal  0.0750747 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4107  fimbrial protein  28.42 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  27.27 
 
 		 176 aa  42.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  26.34 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  26.34 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  26.34 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  27.23 
 
 		 179 aa  41.2  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  27.23 
 
 		 179 aa  41.2  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  27.23 
 
 		 179 aa  41.2  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.23 
 
 		 179 aa  41.2  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  25.13 
 
 		 183 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  26.62 
 
 		 176 aa  40.8  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2877  fimbrial protein  39.29 
 
 		 171 aa  41.2  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>