80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2877 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2877  fimbrial protein  100 
 
 		 171 aa  347  5e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2876  fimbrial protein  88.89 
 
 		 171 aa  309  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4916  protein fimG  33.11 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04150  hypothetical protein  33.11 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04188  minor component of type 1 fimbriae  33.11 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5825  protein fimG  33.11 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3678  Fimbrial protein  33.11 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.343861  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4545  protein fimG  33.11 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4846  protein fimG  33.78 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1269  S-fimbrial adhesin protein SfaS  36.13 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.207899  normal  0.111309 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1068  fimbrial protein  35.29 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1692  protein fimG-like protein  31.4 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01461  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.81 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01473  hypothetical protein  30.81 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2154  fimbrial protein  30.81 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.744663  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2143  Fimbrial protein  30.81 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00578813  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1587  protein fimG-like protein  30.81 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1268  fimbrial protein  33.56 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0400591  normal  0.0675958 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1669  protein FimG-like protein  31.06 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4916  putative fimbrial subunit  29.07 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4843  putative fimbrial protein  28.85 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5005  putative fimbrial subunit  28.85 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5002  putative fimbrial subunit  28.85 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.698647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4950  putative fimbrial subunit  28.85 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  29.55 
 
 		 175 aa  51.6  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  35.44 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2116  protein fimG homolog  33.67 
 
 		 96 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  28.19 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  28.19 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  28.19 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  30.97 
 
 		 176 aa  47.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  30.97 
 
 		 176 aa  47.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  30.97 
 
 		 176 aa  47.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  28.19 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  30.05 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  30.05 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  30.05 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  30.05 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  29.67 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  27.64 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  30.77 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  30.28 
 
 		 210 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  30.77 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  27.64 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167394 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  27.64 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  27.64 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  30.28 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  30.28 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  30.28 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  30.77 
 
 		 170 aa  44.3  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  30.77 
 
 		 170 aa  44.3  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  30.77 
 
 		 170 aa  44.3  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  25.61 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  38.98 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  25.61 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  25.61 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  26.83 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  29.46 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  29.49 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  25.61 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  30.23 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  30.65 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  30.65 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  29.69 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.69 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  30.23 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  27.96 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  29.69 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  29.69 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  27.54 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  25.61 
 
 		 172 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3958  hypothetical protein  26.44 
 
 		 175 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3914  hypothetical protein  26.44 
 
 		 175 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4018  hypothetical protein  26.44 
 
 		 175 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  28.85 
 
 		 181 aa  41.2  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  28.85 
 
 		 181 aa  41.2  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  29.94 
 
 		 202 aa  40.8  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3849  protein LpfE  26.17 
 
 		 175 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551931  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  24.86 
 
 		 184 aa  40.8  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  28.79 
 
 		 174 aa  40.8  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>