136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1268 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1268  fimbrial protein  100 
 
 		 174 aa  360  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0400591  normal  0.0675958 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1269  S-fimbrial adhesin protein SfaS  35.93 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.207899  normal  0.111309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4916  putative fimbrial subunit  31.36 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5005  putative fimbrial subunit  31.36 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4950  putative fimbrial subunit  31.36 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5002  putative fimbrial subunit  31.36 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.698647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4843  putative fimbrial protein  31.36 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4916  protein fimG  33.33 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04188  minor component of type 1 fimbriae  33.33 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3678  Fimbrial protein  33.33 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.343861  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4545  protein fimG  33.33 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4846  protein fimG  32.93 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5825  protein fimG  33.33 
 
 		 167 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1068  fimbrial protein  30.63 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2877  fimbrial protein  33.56 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2876  fimbrial protein  32.21 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1692  protein fimG-like protein  28 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01461  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.68 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2143  Fimbrial protein  29.68 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00578813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2154  fimbrial protein  29.68 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.744663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01473  hypothetical protein  29.68 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1587  protein fimG-like protein  29.68 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1669  protein FimG-like protein  29.25 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  32.89 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  32.89 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  32.89 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  32.89 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  32.89 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  27.84 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  27.84 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  27.84 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.31 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  28.31 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  28.31 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  28.31 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  25.43 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  25.43 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  28.31 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  25.43 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  25.43 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  32.67 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  32.67 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  32.67 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  32.67 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.03 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  31.03 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  31.03 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  31.03 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  31.03 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  27.71 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  26.79 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  27.65 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  27.65 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  27.65 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  30.69 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  27.27 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  28.39 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  32.67 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  30.67 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  27.65 
 
 		 210 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  23.57 
 
 		 171 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  29.07 
 
 		 170 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  29.07 
 
 		 170 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  29.07 
 
 		 170 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  23.57 
 
 		 171 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  23.57 
 
 		 171 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  23.57 
 
 		 168 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  23.57 
 
 		 168 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  24.28 
 
 		 172 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  30.47 
 
 		 171 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  29.2 
 
 		 187 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  29.2 
 
 		 187 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2116  protein fimG homolog  29.7 
 
 		 96 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  27.56 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  23.86 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.69 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  27.44 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  29.69 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  29.69 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  29.69 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  29.44 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  24.47 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  29.44 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  29.44 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  29.44 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  29.44 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2279  Fimbrial protein  28.21 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  26.67 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1053  fimbrial protein  29.14 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.165848  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2380  fimbrial protein  29.14 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  29.28 
 
 		 182 aa  44.7  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  26.87 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  26.87 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  26.87 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  26.9 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  26.9 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  26.9 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  32.81 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  26.67 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>