57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1692 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1692  protein fimG-like protein  100 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01461  predicted fimbrial-like adhesin protein  98.8 
 
 
167 aa  340  5e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01473  hypothetical protein  98.8 
 
 
167 aa  340  5e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2143  Fimbrial protein  98.8 
 
 
167 aa  340  5e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00578813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2154  fimbrial protein  98.8 
 
 
167 aa  340  5e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.744663  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1587  protein fimG-like protein  98.2 
 
 
167 aa  338  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1669  protein FimG-like protein  98.74 
 
 
215 aa  319  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4846  protein fimG  56.63 
 
 
167 aa  201  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2116  protein fimG homolog  97.92 
 
 
96 aa  192  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04150  hypothetical protein  57.23 
 
 
167 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04188  minor component of type 1 fimbriae  57.23 
 
 
167 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3678  Fimbrial protein  57.23 
 
 
167 aa  192  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.343861  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4916  protein fimG  57.23 
 
 
167 aa  192  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4545  protein fimG  57.23 
 
 
167 aa  192  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5825  protein fimG  57.83 
 
 
167 aa  190  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1269  S-fimbrial adhesin protein SfaS  34.81 
 
 
173 aa  87  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.207899  normal  0.111309 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1068  fimbrial protein  31.03 
 
 
183 aa  84.7  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2877  fimbrial protein  31.4 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1268  fimbrial protein  28 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0400591  normal  0.0675958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2876  fimbrial protein  29.07 
 
 
171 aa  67  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  27.97 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  33.06 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4843  putative fimbrial protein  23.37 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  30.16 
 
 
182 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4916  putative fimbrial subunit  23.42 
 
 
185 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  28.12 
 
 
171 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  30.08 
 
 
182 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  23.75 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  28.08 
 
 
180 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  28.68 
 
 
184 aa  44.7  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4950  putative fimbrial subunit  23.37 
 
 
185 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5005  putative fimbrial subunit  23.37 
 
 
185 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238032  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  23.12 
 
 
172 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5002  putative fimbrial subunit  23.37 
 
 
185 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.698647  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  23.12 
 
 
172 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  31.67 
 
 
173 aa  44.7  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  23.12 
 
 
172 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  23.12 
 
 
172 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  26.92 
 
 
172 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  26.92 
 
 
172 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  26.92 
 
 
172 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.167394 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  26.92 
 
 
172 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  27.34 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  27.34 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.34 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  27.4 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  27.34 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  26.58 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  27.34 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  30.4 
 
 
176 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  30.4 
 
 
176 aa  42.4  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  30.4 
 
 
176 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  26.62 
 
 
172 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  26.9 
 
 
179 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  32.71 
 
 
182 aa  41.2  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  25.52 
 
 
179 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  25.71 
 
 
174 aa  40.8  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>