214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0193 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  100 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  98.88 
 
 		 179 aa  355  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  94.41 
 
 		 177 aa  338  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  90 
 
 		 180 aa  325  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  84.7 
 
 		 183 aa  306  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  34.54 
 
 		 185 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  36.94 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  35.8 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  35.63 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  35.63 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  35.63 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  36.02 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  34.02 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  35.45 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  35.16 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  34.54 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  33.16 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  34.21 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  32.53 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  32.53 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  33.54 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  33.54 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  33.54 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  33.54 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  33.54 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  33.54 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  33.54 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  33.54 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  29.44 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  29.44 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.85 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  31.85 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  32.53 
 
 		 186 aa  72  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  31.85 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  31.85 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  31.85 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  31.85 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  34.16 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  33.53 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  33.53 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  33.53 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  33.53 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  33.53 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  33.53 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  35.4 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  33.53 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  33.53 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  34.03 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  30.86 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  30.86 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  30.86 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  30.86 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.66 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  31.66 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  32.03 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  34.59 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  34.59 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  34.59 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  32.91 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  32.91 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  30 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  30.56 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  30.56 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  30.56 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  30.56 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  32.28 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.16 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  32.28 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  31.4 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  32.28 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  32.28 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  32.28 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  32.28 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  32.28 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  30.23 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  30.23 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  30.23 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  30.23 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  33.74 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01468  predicted transcriptional regulator  34.35 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  32.28 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  30.97 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  30.07 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  28.57 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  28.57 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  28.57 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  33.33 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  33.33 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  32.26 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  33.33 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  33.33 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  32.68 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  27.88 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  27.18 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  28.09 
 
 		 336 aa  54.7  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  27.74 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  27.74 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2279  Fimbrial protein  28.66 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  27.63 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  31.72 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>