132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4579 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  100 
 
 		 186 aa  367  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  43.55 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  40.53 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  40.83 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  42.26 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  38.38 
 
 		 186 aa  95.5  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  36.08 
 
 		 185 aa  90.9  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  38.42 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  37.85 
 
 		 184 aa  89.4  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  37.29 
 
 		 182 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  38.8 
 
 		 173 aa  84.7  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  41.72 
 
 		 182 aa  84.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1694  fimbrial protein  38.69 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857438  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  39.2 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  39.2 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  39.2 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  37.43 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  33.51 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  33.51 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  33.51 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  33.51 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  33.51 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  31.94 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  33.69 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  33.69 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  33.69 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  31.94 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  40.36 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  40.22 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  30.73 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  36.22 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  32.11 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  30.89 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  32.43 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  32.43 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  32.43 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  33.53 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  38.24 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  37.65 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  37.65 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  29.84 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  37.65 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  32.54 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  32.54 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.58 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  31.58 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  31.58 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  31.58 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1667  fimbrial protein  34.57 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.384622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  34.43 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  32.54 
 
 		 169 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  29.47 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  36.59 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  36.59 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  36.59 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  36.59 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  36.75 
 
 		 172 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  34.15 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  34.05 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  31.55 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  31.74 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  33.73 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3023  fimbrial subunit CupA1  31.15 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  33.51 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  33.85 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  31.94 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  31.94 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  30.72 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  30.72 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  30.72 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0293  fimbrial protein  30.16 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0298  fimbrial protein  33.53 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1053  fimbrial protein  29.08 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.165848  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2380  fimbrial protein  29.08 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  29.7 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  27.07 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.244383 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  28.4 
 
 		 187 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  28.4 
 
 		 187 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  30.12 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  26.92 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01461  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.69 
 
 		 167 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2143  Fimbrial protein  27.69 
 
 		 167 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00578813  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01473  hypothetical protein  27.69 
 
 		 167 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1587  protein fimG-like protein  27.69 
 
 		 167 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  26.51 
 
 		 176 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2154  fimbrial protein  27.69 
 
 		 167 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.744663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  26.51 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  28.82 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  26.51 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  25.9 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  25.9 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  25.9 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1692  protein fimG-like protein  26.92 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  25.9 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  25.9 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1669  protein FimG-like protein  27.69 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02258  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.47 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02218  hypothetical protein  27.47 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.918949  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  26.04 
 
 		 190 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  26.04 
 
 		 190 aa  44.7  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>