128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6667 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  100 
 
 		 207 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  63.11 
 
 		 180 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  53.14 
 
 		 181 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  52.66 
 
 		 181 aa  201  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  61.54 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  56.49 
 
 		 184 aa  158  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  39.76 
 
 		 181 aa  99  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  39.76 
 
 		 181 aa  98.2  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  39.76 
 
 		 181 aa  98.2  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  38 
 
 		 187 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  38 
 
 		 181 aa  87.8  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  37.04 
 
 		 182 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  38.22 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  37.27 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  36.65 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  39.51 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  35.76 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  32.94 
 
 		 178 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  32.94 
 
 		 178 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  32.94 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  34.46 
 
 		 190 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  34.46 
 
 		 190 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  32.35 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  32.35 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  35.03 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  33.54 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  36.48 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  34.12 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  35.37 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.244383 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  35.06 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  33.96 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  32.2 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  32.2 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  32.2 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  33.12 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  35.44 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  33.73 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  31.18 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  34.42 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  34.42 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  37.23 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  30.66 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  31.21 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  33.74 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  26.67 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  34.42 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  31.21 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  30.66 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  30.66 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  31.21 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  32.52 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  26.19 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  28.39 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  28.39 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  28.39 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  31.87 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  32.5 
 
 		 179 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  36.2 
 
 		 179 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1694  fimbrial protein  38.61 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857438  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  27.53 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  26.99 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  26.99 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  33.77 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  32.24 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.87 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  31.87 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  30 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  31.87 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  31.87 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1053  fimbrial protein  31.87 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.165848  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  27.16 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2380  fimbrial protein  31.87 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  36.19 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  24.76 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0298  fimbrial protein  33.33 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  26.92 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  26.92 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  26.92 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  26.92 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2870  fimbrial protein  28.57 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  26.92 
 
 		 165 aa  48.9  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  26.92 
 
 		 165 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  29.44 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  24.76 
 
 		 185 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  26.28 
 
 		 165 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6650  fimbrial protein  27.89 
 
 		 313 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136296 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  28.22 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  28 
 
 		 174 aa  45.8  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  29.89 
 
 		 182 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  24.68 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  24.68 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  33.03 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  24.68 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2279  Fimbrial protein  26.9 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  24.68 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1366  fimbrial protein  28.64 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326274  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1478  fimbrial protein  28.64 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  29.8 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  29.8 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  29.8 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>