87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1277 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  100 
 
 
186 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.244383 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  44.51 
 
 
202 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  40.11 
 
 
183 aa  104  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1667  fimbrial protein  39.78 
 
 
179 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.384622  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  36.36 
 
 
176 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  36.36 
 
 
176 aa  96.7  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  36.36 
 
 
176 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  39.26 
 
 
176 aa  95.1  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  39.26 
 
 
176 aa  95.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  39.26 
 
 
176 aa  95.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  39.88 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  39.88 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  39.88 
 
 
178 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  39.26 
 
 
178 aa  90.9  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  39.26 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  35.68 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3023  fimbrial subunit CupA1  36.36 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0298  fimbrial protein  36.59 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0293  fimbrial protein  31.48 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  35.37 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  34.96 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  32.12 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  33.51 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  32.52 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  30.91 
 
 
184 aa  61.2  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  30.21 
 
 
181 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  30.51 
 
 
169 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  30.21 
 
 
181 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  34.52 
 
 
179 aa  59.3  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  30.54 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  29.95 
 
 
173 aa  57.8  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  29.51 
 
 
180 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  29.51 
 
 
180 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  29.51 
 
 
180 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  29.88 
 
 
182 aa  55.1  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  29.74 
 
 
180 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  27.07 
 
 
186 aa  54.7  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  30.96 
 
 
184 aa  52.4  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  29.69 
 
 
181 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  29.69 
 
 
181 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  29.69 
 
 
181 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  29.69 
 
 
181 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  29.17 
 
 
181 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  28.31 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  29.63 
 
 
182 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  29.19 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  29.19 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  29.19 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  28.89 
 
 
176 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  43.94 
 
 
182 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  29.29 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  29.29 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  29.29 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4153  fimbrial protein  26.47 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2870  fimbrial protein  24.84 
 
 
202 aa  45.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  38.24 
 
 
175 aa  44.7  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  23.93 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1323  Fimbrial protein  27.22 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.539494  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  30.06 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2628  fimbrial protein  27.62 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  30.06 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  28.34 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  29.65 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  26.24 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  30.06 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  30.18 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  30.06 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  30.06 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  30.06 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  30.06 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1366  fimbrial protein  24.07 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  29.29 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  28.8 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  30 
 
 
172 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  28.57 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  29.12 
 
 
177 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  30 
 
 
172 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1478  fimbrial protein  24.07 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  30.06 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0211  major fimbrial subunit  29.17 
 
 
201 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.698647  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  30 
 
 
172 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  30 
 
 
172 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  31.2 
 
 
174 aa  42.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  32.74 
 
 
175 aa  42  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02258  predicted fimbrial-like adhesin protein  23.86 
 
 
183 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  30.05 
 
 
177 aa  42  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02218  hypothetical protein  23.86 
 
 
183 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.918949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>