26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0211 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0211  major fimbrial subunit  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.698647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0150  fimbrial protein  31.31 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00359988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  30.89 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3518  fimbrial protein  29.15 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00642189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  27.32 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  29.9 
 
 		 177 aa  51.6  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  28.5 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  34.87 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  30.61 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  29.08 
 
 		 174 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  29.08 
 
 		 174 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  29.08 
 
 		 174 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  29.17 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  29.17 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  31.28 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  31.28 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  30.77 
 
 		 180 aa  46.6  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  31.64 
 
 		 179 aa  45.1  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  38.1 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  27.08 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  27.62 
 
 		 182 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  28.9 
 
 		 175 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  26.73 
 
 		 182 aa  41.6  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  30.3 
 
 		 176 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  30.3 
 
 		 176 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  30.3 
 
 		 176 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>