140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1786 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  100 
 
 		 180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  100 
 
 		 180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  99.44 
 
 		 180 aa  354  2.9999999999999997e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  46.37 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  43.75 
 
 		 184 aa  110  9e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  41.18 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  43.23 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  41.53 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  42.63 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  41.1 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  41.28 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  44.3 
 
 		 182 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  41.98 
 
 		 183 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  39.9 
 
 		 185 aa  90.9  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  41.57 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  40.99 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  34.95 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  40.48 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  37.43 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  34.41 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  36.41 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1694  fimbrial protein  44.22 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857438  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  38.83 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  34.88 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  34.24 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  32.2 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  35 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  32.2 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  33.33 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  33.33 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  33.33 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  31.41 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  34.71 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  34.71 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  34.59 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  34.59 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  34.71 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  34.1 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  34.59 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3023  fimbrial subunit CupA1  35.64 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  39.35 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  32.22 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  32.22 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  32.22 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.77 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  35.29 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  35.29 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  35.29 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  29.65 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  33.99 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  31.25 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.25 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  27.75 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  33.99 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  30.66 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0293  fimbrial protein  31.55 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  27.12 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  27.12 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  27.12 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  27.12 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  27.12 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  27.12 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  29.27 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.244383 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  34.25 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  27.12 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  32.03 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  26.55 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  24.46 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  30.17 
 
 		 176 aa  51.6  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  30.17 
 
 		 176 aa  51.6  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  30.17 
 
 		 176 aa  51.6  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  23.91 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  23.91 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  23.91 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  23.91 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  24.46 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  23.91 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  23.91 
 
 		 176 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  26.26 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  27.27 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  25.7 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  28.72 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11060  putative fimbrial subunit CupB1  26.16 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  25.7 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  25.7 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  25.7 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  26.74 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  26.74 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  26.74 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  26.74 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  26.74 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  28.21 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  28.09 
 
 		 180 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  27.91 
 
 		 174 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1667  fimbrial protein  30.17 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.384622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69760  putative fimbrial protein  28.81 
 
 		 304 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0511825  normal  0.411103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  29.65 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  29.65 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2870  fimbrial protein  27.96 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  29.65 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>