51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2870 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2870  fimbrial protein  100 
 
 		 202 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1478  fimbrial protein  96.53 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1366  fimbrial protein  96.53 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326274  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  38.12 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  38.75 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  38.75 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  36.63 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  32.28 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  29.73 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  34.33 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  31 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  31 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  31.45 
 
 		 169 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6650  fimbrial protein  27.81 
 
 		 313 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  40.48 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  27.84 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  30.52 
 
 		 176 aa  51.6  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  30.52 
 
 		 176 aa  51.6  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  30.52 
 
 		 176 aa  51.6  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  28.22 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  31.97 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  31.58 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  27.95 
 
 		 178 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  29.59 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  27.95 
 
 		 178 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  27.95 
 
 		 178 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  27.95 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  30 
 
 		 184 aa  48.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  28.49 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  27.95 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  27.96 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  27.96 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  46.3 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  46.3 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  46.3 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  29.19 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  31.07 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  27.78 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  24.84 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.244383 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  28.74 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  29.93 
 
 		 175 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  30.71 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  41.07 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  30.57 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  30.57 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  35.71 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  30.57 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  30.77 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  29.73 
 
 		 190 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  29.73 
 
 		 190 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  29.73 
 
 		 187 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>