97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1153 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  100 
 
 		 186 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  45.99 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  44.65 
 
 		 175 aa  99.4  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  38.8 
 
 		 184 aa  98.2  7e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  43.79 
 
 		 186 aa  97.8  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  38.8 
 
 		 184 aa  97.8  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  38.64 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  38.98 
 
 		 186 aa  91.7  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  38.92 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  43.62 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  43.16 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  38.89 
 
 		 184 aa  84.3  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  37.28 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  36.02 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  36.02 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  36.02 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  36.02 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  36.02 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  37.43 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  37.43 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  37.43 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  33.85 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  33.33 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  33.33 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  33.33 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  34.38 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  36 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  34.76 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  34.76 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  34.76 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  38.41 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  36.94 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  36.94 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  33.96 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  36.94 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  36.94 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  34.52 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  36.02 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0298  fimbrial protein  37.34 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  32.91 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  35.03 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  32.98 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  33.15 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.244383 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  32.98 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1667  fimbrial protein  33.51 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.384622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2870  fimbrial protein  29.73 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  34.12 
 
 		 169 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  33.13 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0293  fimbrial protein  31.35 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  36.71 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1694  fimbrial protein  39.05 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857438  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1478  fimbrial protein  28.14 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1366  fimbrial protein  28.14 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326274  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4153  fimbrial protein  28.28 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  28.49 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  28.49 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  28.49 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  28.49 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  27.96 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  31.06 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  30.73 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  33.87 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  31.69 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  28.8 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  30.43 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  33.16 
 
 		 182 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  29.53 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  33.33 
 
 		 181 aa  47.8  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3023  fimbrial subunit CupA1  30.73 
 
 		 182 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  33.33 
 
 		 181 aa  47.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  28.26 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  28.26 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2380  fimbrial protein  31.91 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  30.17 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1053  fimbrial protein  31.91 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.165848  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  30.17 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  29.26 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  30.9 
 
 		 177 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  31.05 
 
 		 183 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  31.87 
 
 		 180 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  31.87 
 
 		 180 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  31.87 
 
 		 180 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  31.87 
 
 		 172 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  31.87 
 
 		 180 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  28.72 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  26.21 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.72 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6650  fimbrial protein  31.71 
 
 		 313 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136296 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0152  fimbrial protein  27.64 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00100089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  28.72 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  28.72 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0232  putative fimbrial subunit  25.14 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0214  putative fimbrial subunit  25.14 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0231  putative fimbrial subunit  25.14 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0216  putative fimbrial subunit  25.14 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.17546  normal  0.944353 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  29.61 
 
 		 180 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  25.13 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>