83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3023 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3023  fimbrial subunit CupA1  100 
 
 		 182 aa  352  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  80.22 
 
 		 182 aa  290  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  72.32 
 
 		 183 aa  238  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  47.83 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0298  fimbrial protein  43.9 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  41.04 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  41.04 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  41.04 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0293  fimbrial protein  39.04 
 
 		 180 aa  97.8  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1667  fimbrial protein  43.5 
 
 		 179 aa  95.5  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.384622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  38.8 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  38.8 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  38.8 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  36.42 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.244383 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  35.48 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  35.48 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  35.48 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  35.48 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  35.48 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  35.64 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  35.64 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  35.64 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  31.76 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  34.34 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  32.79 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  32.79 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  32.79 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  32.79 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  33.7 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  32.8 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  35.8 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  31.69 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  41.22 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  33.16 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.42 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  26.88 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  26.88 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  26.88 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  35.75 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  33.7 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  33.7 
 
 		 210 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  33.7 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  33.7 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  31.65 
 
 		 176 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  31.65 
 
 		 176 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  31.65 
 
 		 176 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  31.05 
 
 		 181 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  31.05 
 
 		 181 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  34.57 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  34.5 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  31.48 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  26.34 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  33.72 
 
 		 182 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  35.35 
 
 		 186 aa  48.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  35.77 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  32.96 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  31.22 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  32.96 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  32.96 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  30.22 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  32.6 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  32.08 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  28.48 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  28.65 
 
 		 336 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  28.19 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  32.62 
 
 		 207 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  27.66 
 
 		 190 aa  44.3  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  27.66 
 
 		 190 aa  44.3  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  31.85 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  38.83 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  31.85 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  30.27 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  31.85 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  31.85 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  30.27 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  31.85 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  27.81 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  33 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  25.81 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  33 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  28.42 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  31.91 
 
 		 306 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  26.2 
 
 		 177 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>