166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4022 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  100 
 
 		 183 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  45.18 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  44.02 
 
 		 182 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  39.15 
 
 		 184 aa  114  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  38.1 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  40.31 
 
 		 184 aa  107  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  37.5 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  42.68 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  38.86 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  42.22 
 
 		 180 aa  100  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  42.22 
 
 		 180 aa  100  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  41.57 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  41.67 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  36.26 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  39.75 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1694  fimbrial protein  43.31 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857438  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  36.2 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  37.08 
 
 		 181 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  36.52 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  36.57 
 
 		 169 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  35.68 
 
 		 186 aa  84.3  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  34.81 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  40.36 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  35.05 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11060  putative fimbrial subunit CupB1  34.87 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  33.69 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  33.69 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  33.69 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  33.33 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  34.93 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  34.25 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  31.74 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  31.74 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  31.74 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  33.12 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  31.74 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  32.28 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  31.74 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  31.58 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  31.58 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  31.58 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  30.96 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  33.33 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  30.46 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  30.46 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  29.22 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  30.54 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.244383 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1532  fimbrial protein  31.18 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.690066 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  29.21 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  29.21 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  29.21 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  34.59 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  28.32 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  29.21 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  29.21 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  29.21 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  28.32 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  28.32 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  29.21 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  28.65 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  28.36 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  33.54 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  33.54 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  33.54 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  33.54 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  35.26 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  29.95 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  29.95 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  29.95 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  32.92 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  29.45 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6650  fimbrial protein  31.41 
 
 		 313 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136296 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  31.91 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3023  fimbrial subunit CupA1  31.55 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  27.81 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  30.3 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  28.92 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  26.7 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  26.7 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  51.72 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  26.7 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  26.7 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4153  fimbrial protein  26.49 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  26.92 
 
 		 181 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  26.6 
 
 		 195 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  26.92 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  26.92 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  26.92 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  26.82 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  38.1 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  27.36 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  27.36 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  27.53 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4460  putative type 1 fimbrial protein  26.92 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  31.65 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  27.33 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3624  fimbrial protein  26.92 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  27.53 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  27.53 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  28.09 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>