173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1694 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1694  fimbrial protein  100 
 
 		 209 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857438  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  52.88 
 
 		 184 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  53.37 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  43.43 
 
 		 186 aa  115  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  46.91 
 
 		 175 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  44.91 
 
 		 182 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  42.78 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  45.78 
 
 		 182 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  43.33 
 
 		 184 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  43.79 
 
 		 184 aa  102  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  39.55 
 
 		 195 aa  101  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  42.35 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  42.35 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  42.35 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  43.89 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  47.83 
 
 		 179 aa  97.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  39.63 
 
 		 173 aa  94.7  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  38.81 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  36.45 
 
 		 202 aa  84.7  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  41.04 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  40.62 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  46.06 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  37.82 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  37.82 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  37.82 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  36.87 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  38.6 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  38.6 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  36.42 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  36.54 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  36.26 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  36.71 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  33.16 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  33.33 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  33.33 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  33.85 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  33.68 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4153  fimbrial protein  31.82 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  33.51 
 
 		 169 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  34.62 
 
 		 176 aa  72  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  34.62 
 
 		 176 aa  72  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  34.62 
 
 		 176 aa  72  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  33.89 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  36.94 
 
 		 181 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  33.33 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  31.89 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0298  fimbrial protein  38.89 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  34.09 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  34.09 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  34.09 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  32.28 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  32.28 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  32.28 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  30.65 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  30.11 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1667  fimbrial protein  39.29 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.384622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  30.11 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  30.11 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  31.58 
 
 		 181 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  31.58 
 
 		 181 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  31.58 
 
 		 181 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  31.58 
 
 		 181 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  30.49 
 
 		 183 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  32.56 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.05 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  32.61 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  31.05 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  32.32 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  29.9 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  31.1 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11060  putative fimbrial subunit CupB1  31.58 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  32.11 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.05 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  27.78 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  31.68 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  31.68 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  29.07 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  27.96 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  27.42 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  27.42 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  29.38 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  29.21 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  30.25 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  29.21 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  29.21 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  29.21 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  31.93 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.244383 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  31.1 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  30.41 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  26.44 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1532  fimbrial protein  30.35 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.690066 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  30.41 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3023  fimbrial subunit CupA1  35.76 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  26.88 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  26.88 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0293  fimbrial protein  28.65 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  26.88 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  26.88 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  26.88 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  32.72 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>