98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0298 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0298  fimbrial protein  100 
 
 
180 aa  345  3e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0293  fimbrial protein  54.14 
 
 
180 aa  175  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  52.41 
 
 
202 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  52.49 
 
 
176 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  52.49 
 
 
176 aa  153  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  52.49 
 
 
176 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1667  fimbrial protein  54.35 
 
 
179 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.384622  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  47.85 
 
 
178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  47.85 
 
 
178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  47.31 
 
 
178 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  47.31 
 
 
178 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  47.31 
 
 
178 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  47.9 
 
 
182 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3023  fimbrial subunit CupA1  43.78 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  43.01 
 
 
176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  43.01 
 
 
176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  44.44 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  43.01 
 
 
176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  36.59 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.244383 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  42.11 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  37.99 
 
 
186 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  38.42 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  36.76 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  34.59 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  34.38 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  42.98 
 
 
175 aa  64.3  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  38.74 
 
 
186 aa  62  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  33.74 
 
 
186 aa  61.6  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  35.11 
 
 
182 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  37.04 
 
 
185 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  33.33 
 
 
207 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  34.16 
 
 
182 aa  54.7  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0152  fimbrial protein  29.44 
 
 
194 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00100089  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  32.28 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  28.02 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  32.28 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  29.9 
 
 
195 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  32.28 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  29.89 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  29.89 
 
 
180 aa  52.4  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  29.89 
 
 
180 aa  52.4  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  43.75 
 
 
179 aa  51.6  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.221625 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3461  Fimbrial protein  28.93 
 
 
194 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000984412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0145  fimbrial protein  28.93 
 
 
194 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000164783  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  32.95 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00139  hypothetical protein  28.93 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00369206  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00140  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.93 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0047782  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  31.49 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  31.49 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  31.49 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  32.28 
 
 
180 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  27.98 
 
 
187 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  32.28 
 
 
180 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  30.48 
 
 
180 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  32.28 
 
 
180 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  32.28 
 
 
180 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  29.28 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  29.28 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  29.28 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  29.28 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1694  fimbrial protein  38.89 
 
 
209 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857438  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  30 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  27.23 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  29.23 
 
 
193 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  26.78 
 
 
174 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  36.84 
 
 
182 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  26.78 
 
 
174 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  33.12 
 
 
172 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  26.78 
 
 
174 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  26.78 
 
 
174 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  30.25 
 
 
183 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  34.78 
 
 
174 aa  44.7  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  32.89 
 
 
187 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  27.72 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  29.1 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  29.1 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  40.68 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  29.27 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  29.27 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  28.72 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  38.74 
 
 
190 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  29.75 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  28.28 
 
 
195 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  26.37 
 
 
179 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  27.47 
 
 
177 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  38.74 
 
 
190 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  23.64 
 
 
176 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  26.37 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  23.64 
 
 
176 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  23.64 
 
 
176 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  38.74 
 
 
187 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  36.89 
 
 
181 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  26.37 
 
 
180 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  30.12 
 
 
170 aa  41.6  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1478  fimbrial protein  37.04 
 
 
202 aa  40.8  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  26.75 
 
 
184 aa  40.8  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  28.75 
 
 
182 aa  40.8  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1366  fimbrial protein  37.04 
 
 
202 aa  40.8  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>