17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3461 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00140  predicted fimbrial-like adhesin protein  99.48 
 
 		 194 aa  387  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0047782  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3461  Fimbrial protein  100 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000984412  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00139  hypothetical protein  99.48 
 
 		 194 aa  387  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00369206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0145  fimbrial protein  100 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000164783  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0152  fimbrial protein  92.27 
 
 		 194 aa  362  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00100089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0132  hypothetical protein  96.75 
 
 		 124 aa  239  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000008388  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3518  fimbrial protein  41.24 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00642189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0150  fimbrial protein  39.58 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00359988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0209  pilin chaperone ecpD2  37.22 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3976  pilin chaperone ecpD2  36.46 
 
 		 208 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  27.03 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1667  fimbrial protein  26.74 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.384622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  28.93 
 
 		 173 aa  41.6  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  23.62 
 
 		 179 aa  41.6  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  23.62 
 
 		 179 aa  41.6  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  23.62 
 
 		 179 aa  41.6  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  23.62 
 
 		 179 aa  41.6  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>