17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0209 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0209  pilin chaperone ecpD2  100 
 
 		 197 aa  390  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3518  fimbrial protein  41.09 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00642189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0150  fimbrial protein  42.36 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00359988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3976  pilin chaperone ecpD2  43.55 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0152  fimbrial protein  38.67 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00100089  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3461  Fimbrial protein  37.22 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000984412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0145  fimbrial protein  37.22 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000164783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00139  hypothetical protein  37.22 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00369206  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00140  predicted fimbrial-like adhesin protein  37.22 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0047782  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0132  hypothetical protein  40.62 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000008388  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  28.86 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  28.86 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  28.86 
 
 		 181 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3927  putative fimbrial protein FanC  30.3 
 
 		 175 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.662552 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  28.93 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  28.93 
 
 		 180 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  28.93 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>