14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B3976 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3976  pilin chaperone ecpD2  100 
 
 		 208 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3518  fimbrial protein  45.02 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00642189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0150  fimbrial protein  45.97 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00359988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0209  pilin chaperone ecpD2  42.86 
 
 		 197 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0152  fimbrial protein  38.57 
 
 		 194 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00100089  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3461  Fimbrial protein  36.19 
 
 		 194 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000984412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0145  fimbrial protein  36.19 
 
 		 194 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000164783  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00140  predicted fimbrial-like adhesin protein  36.19 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0047782  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00139  hypothetical protein  36.19 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00369206  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0132  hypothetical protein  37.69 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000008388  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4153  fimbrial protein  36.43 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  38.78 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  32.79 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0211  major fimbrial subunit  28.05 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.698647  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>