213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4250 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  100 
 
 		 175 aa  339  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  64.1 
 
 		 182 aa  157  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  50.28 
 
 		 184 aa  148  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  47.25 
 
 		 184 aa  141  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  48.13 
 
 		 184 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  48.02 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  43.48 
 
 		 186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  44.26 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  45.3 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  42.62 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  42.62 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  42.62 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  44.72 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  42.5 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  52.23 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  36.26 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1694  fimbrial protein  46.91 
 
 		 209 aa  97.1  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857438  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  38.79 
 
 		 186 aa  93.2  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  37.02 
 
 		 180 aa  91.7  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  39.34 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  39.34 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  39.34 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  39.34 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  39.34 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  38.41 
 
 		 190 aa  87.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  38.41 
 
 		 190 aa  87.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  38.41 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  39.34 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  33.33 
 
 		 195 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  34.43 
 
 		 181 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  32.04 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  32.04 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  32.04 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  33.88 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  36.42 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  38.82 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  35.44 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  33.77 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  32.69 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  37.75 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  37.3 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  34.59 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  34.59 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  34.59 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  39.51 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  30.05 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11060  putative fimbrial subunit CupB1  33.16 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  35.71 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  30.6 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  30.6 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  30.82 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4153  fimbrial protein  31.84 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  29.9 
 
 		 190 aa  62  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  30.51 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  30.51 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  30.51 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  30.51 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  29.38 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  29.38 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  36.26 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  29.51 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.51 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  29.51 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  29.51 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  32.18 
 
 		 336 aa  58.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  32.45 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2380  fimbrial protein  31.44 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1053  fimbrial protein  31.44 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.165848  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  32.4 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  32.42 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  28.89 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  32.4 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  32.4 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  28.57 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3023  fimbrial subunit CupA1  36.61 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  32.42 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  28.57 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  32.42 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  31.33 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  31.33 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  31.65 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  36.9 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  31.33 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  31.33 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.21 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  29.21 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  29.21 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0298  fimbrial protein  33.69 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  29.21 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  28.96 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  33.14 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  32.39 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  33.53 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  33.53 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  33.53 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  33.53 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  33.53 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  29.95 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  29.95 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0293  fimbrial protein  39.08 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>