151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1100 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  100 
 
 
179 aa  354  5e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  98.88 
 
 
179 aa  349  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  98.88 
 
 
179 aa  349  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  98.88 
 
 
179 aa  349  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  98.88 
 
 
179 aa  349  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  92.74 
 
 
179 aa  332  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1053  fimbrial protein  84.44 
 
 
180 aa  296  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.165848  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2380  fimbrial protein  84.44 
 
 
180 aa  296  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  40.56 
 
 
180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  40.56 
 
 
180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  40.56 
 
 
180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  40.56 
 
 
180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  42.76 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  34.64 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  34.64 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  34.64 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  34.64 
 
 
210 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  31.89 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  31.89 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  31.89 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  33.7 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  33.53 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  31.61 
 
 
187 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  31.61 
 
 
187 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  33.55 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  33.14 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  33.14 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  33.14 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  32.48 
 
 
170 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  32.48 
 
 
170 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  33.76 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  30.59 
 
 
174 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  26.45 
 
 
165 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  29.57 
 
 
185 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  30.05 
 
 
181 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  30.05 
 
 
181 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  25.81 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  25.81 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  25.81 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  25.81 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  27.93 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  32.28 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  28.42 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  25.81 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  34.84 
 
 
184 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  33.54 
 
 
184 aa  58.9  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  35.22 
 
 
182 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  26.32 
 
 
165 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  25.95 
 
 
182 aa  58.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  29.74 
 
 
183 aa  57.8  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  30.07 
 
 
176 aa  57.8  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  30.38 
 
 
185 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  32.16 
 
 
169 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  29.63 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  29.03 
 
 
185 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  32.91 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  32.26 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  27.37 
 
 
174 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  35.26 
 
 
182 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  35.26 
 
 
182 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  31.52 
 
 
177 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  27.37 
 
 
174 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  35.26 
 
 
182 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  27.37 
 
 
174 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  32.5 
 
 
207 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  32.98 
 
 
179 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1268  fimbrial protein  31.03 
 
 
174 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0400591  normal  0.0675958 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  28.49 
 
 
185 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0822  Fimbrial protein  26.67 
 
 
189 aa  54.3  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1057  Fimbrial protein  27.27 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  27.37 
 
 
174 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  28.49 
 
 
185 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  29.12 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  35.66 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  32.08 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  32.08 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  32.08 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  30.65 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  27.37 
 
 
170 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  29.63 
 
 
175 aa  52  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  27.37 
 
 
170 aa  52  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01468  predicted transcriptional regulator  33.61 
 
 
178 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  30.52 
 
 
176 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  28.57 
 
 
176 aa  51.6  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  28.57 
 
 
176 aa  51.6  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  28.57 
 
 
176 aa  51.6  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  28.57 
 
 
176 aa  51.6  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  29.8 
 
 
187 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  31.38 
 
 
176 aa  51.6  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  26.82 
 
 
171 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  31.38 
 
 
176 aa  51.6  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  31.38 
 
 
176 aa  51.6  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  31.44 
 
 
178 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  29.8 
 
 
171 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  31.44 
 
 
178 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  29.8 
 
 
171 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  26.49 
 
 
187 aa  51.2  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4916  protein fimG  31.37 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  30.68 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.14 
 
 
171 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>