282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0589 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  100 
 
 
185 aa  370  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  99.46 
 
 
185 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  98.92 
 
 
185 aa  367  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  98.92 
 
 
185 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  98.38 
 
 
185 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  70.33 
 
 
187 aa  259  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  71.15 
 
 
180 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  71.15 
 
 
180 aa  207  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  71.15 
 
 
180 aa  207  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  71.15 
 
 
180 aa  207  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  71.15 
 
 
180 aa  207  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  71.15 
 
 
180 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  71.15 
 
 
180 aa  207  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  71.15 
 
 
180 aa  207  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  51.87 
 
 
183 aa  171  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  51.08 
 
 
184 aa  154  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  55.41 
 
 
182 aa  152  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  56.33 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  49.36 
 
 
187 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  49.36 
 
 
187 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.515875 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  55.41 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  55.41 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  55.41 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  41.18 
 
 
170 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0589  fimbrial protein internal segment  35.22 
 
 
164 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0147243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0590  fimbrial protein internal segment  35.22 
 
 
164 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0238251  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0654  fimbrial protein internal segment  34.59 
 
 
164 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.781355  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0988  fimbrial protein  33.75 
 
 
181 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.991205  normal  0.0750747 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0597  fimbrial protein internal segment  34.59 
 
 
164 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0916045 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  37.91 
 
 
174 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  33.16 
 
 
179 aa  99  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  33.16 
 
 
179 aa  99  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  33.13 
 
 
165 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  33.16 
 
 
179 aa  99  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  33.16 
 
 
179 aa  99  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  40.52 
 
 
170 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  39.22 
 
 
174 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  40.52 
 
 
170 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  40.52 
 
 
170 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  39.87 
 
 
170 aa  97.8  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  39.87 
 
 
170 aa  97.8  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  36.36 
 
 
174 aa  97.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  36.36 
 
 
174 aa  97.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  36.36 
 
 
174 aa  97.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  31.93 
 
 
165 aa  97.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  32.53 
 
 
165 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01468  predicted transcriptional regulator  46.72 
 
 
178 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  36.76 
 
 
173 aa  92.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  37.91 
 
 
210 aa  90.9  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  37.91 
 
 
170 aa  90.9  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  37.91 
 
 
170 aa  90.9  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  37.91 
 
 
170 aa  90.9  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  35.71 
 
 
171 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  35.71 
 
 
171 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  35.71 
 
 
171 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  35.64 
 
 
190 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  35.71 
 
 
168 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  35.71 
 
 
168 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  35.15 
 
 
190 aa  88.6  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  35.15 
 
 
190 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  30.81 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  35.29 
 
 
177 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  37.66 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  34.46 
 
 
172 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  36.36 
 
 
176 aa  87.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  34.46 
 
 
172 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  34.46 
 
 
172 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  35.98 
 
 
179 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  34.46 
 
 
172 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  32.45 
 
 
176 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  32.45 
 
 
176 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  32.45 
 
 
176 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  34.54 
 
 
179 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  34.22 
 
 
176 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  34.22 
 
 
176 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  34.22 
 
 
176 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  34.22 
 
 
176 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  34.59 
 
 
175 aa  84.7  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  33.33 
 
 
172 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  34.22 
 
 
176 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  33.87 
 
 
176 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  33.7 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  33.7 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  34.64 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  34.64 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  34.22 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  34.64 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  33.7 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  33.7 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  33.15 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  34.64 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  34.64 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  34.64 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  33.69 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  33.69 
 
 
176 aa  82  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  34.64 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  38.06 
 
 
180 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  38.06 
 
 
180 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  38.06 
 
 
180 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  34.64 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>