248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1664 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  100 
 
 		 187 aa  371  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  100 
 
 		 187 aa  371  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01468  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 178 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  63.64 
 
 		 184 aa  224  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  70.13 
 
 		 182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  70.13 
 
 		 182 aa  208  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  70.13 
 
 		 182 aa  208  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  70.13 
 
 		 182 aa  208  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  68.79 
 
 		 182 aa  207  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  46.81 
 
 		 187 aa  158  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  45.21 
 
 		 185 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  45.21 
 
 		 185 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  44.68 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  44.68 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  49.36 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  49.69 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  49.38 
 
 		 180 aa  128  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  48.75 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  48.75 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  48.75 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  48.75 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  48.75 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  48.75 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  48.75 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  47.02 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  47.02 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  45.7 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  45.7 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  45.7 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  46.36 
 
 		 170 aa  111  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  46.36 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  42.57 
 
 		 180 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  42.57 
 
 		 180 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  42.57 
 
 		 180 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  42.57 
 
 		 180 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  43.92 
 
 		 172 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  37.1 
 
 		 174 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  41.06 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  41.06 
 
 		 170 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  41.06 
 
 		 170 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  41.06 
 
 		 170 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  34.05 
 
 		 174 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  34.05 
 
 		 174 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  34.05 
 
 		 174 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  32.62 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  32.62 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  32.62 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  32.62 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  35.26 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  36.67 
 
 		 173 aa  89.4  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  34.62 
 
 		 165 aa  88.6  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  32.97 
 
 		 174 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  34.62 
 
 		 165 aa  87  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0988  fimbrial protein  32.1 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.991205  normal  0.0750747 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  35.12 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  34.52 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  34.52 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  32.29 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  37.89 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  32.53 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  36.71 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  38.71 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  32.09 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  32.09 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  32.09 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  32.53 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  29.21 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  32.93 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  32.33 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  36.24 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167394 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  36.24 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  36.24 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  36.24 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  32.5 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  36.18 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.91 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  31.91 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  31.91 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  31.91 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  30.63 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  35.57 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  31.91 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  31.21 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.43 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  29.1 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  30.43 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  30.43 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  30.43 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  32.89 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  32.89 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  32.89 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  32.89 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  29.1 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  32.89 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  31.54 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0590  fimbrial protein internal segment  25.81 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0238251  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0589  fimbrial protein internal segment  25.81 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0147243 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  33.53 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  30.57 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  31.9 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>