160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4677 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  100 
 
 		 179 aa  371  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0408  fimbrial protein  44.22 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  39.04 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4717  fimbrial protein  38.16 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0885059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  35.45 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  38.1 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  38.1 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  38.1 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  38.1 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  38.1 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  38.93 
 
 		 177 aa  101  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4139  fimbrial protein  36.24 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  32.6 
 
 		 179 aa  99.4  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0822  Fimbrial protein  31.41 
 
 		 189 aa  85.1  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  31.89 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2492  putative minor fimbrial subunit  35.1 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000455389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  34.44 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1057  Fimbrial protein  30.86 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2485  fimbrial protein  34.69 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  33.12 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1319  fimbrial protein  34.69 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  31.45 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3474  fimbrial protein  29.05 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.855494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  31.07 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  31.07 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  31.07 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  31.25 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  30.59 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  30.59 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  30.59 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  30.59 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  30.59 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  32 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  32 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  30.59 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3093  fimbrial subunit  30.82 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  29.67 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3176  fimbrial subunit  30.82 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.312999 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  32 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3274  fimbrial subunit  30.82 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  32 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  32 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  32 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1323  Fimbrial protein  34.03 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.539494  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3157  fimbrial subunit  30.82 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.243757 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2628  fimbrial protein  33.33 
 
 		 179 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  30 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  30 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  30 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  30 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  29.56 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  29.56 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  32.28 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  30 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0236  minor fimbrial subunit StfG  31.13 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  30 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4675  fimbrial protein  27.38 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0214  putative fimbrial subunit  32.28 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  36.36 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  36.36 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0216  putative fimbrial subunit  32.28 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.17546  normal  0.944353 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0231  putative fimbrial subunit  32.28 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0232  putative fimbrial subunit  32.28 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69001  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  28.93 
 
 		 185 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  30.91 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  35.57 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  30.06 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  35.57 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  35.57 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  27.47 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  27.47 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  27.47 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  28.93 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  35.57 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  35.57 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  35.57 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  39.34 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  39.34 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  34.11 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  34.11 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  29.66 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  34.11 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0219  minor fimbrial subunit StfG  32.03 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000084521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0221  minor fimbrial subunit StfG  32.03 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000010852  normal  0.588563 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  30.3 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  30.3 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  30 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  35.57 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  30.3 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  28.3 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  30.3 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0237  minor fimbrial subunit StfG  31.25 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000054722  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  31.68 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  26.98 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  26.92 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02258  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.07 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02218  hypothetical protein  30.07 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.918949  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  26.49 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3088  putative fimbrial subunit  28.49 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  28.3 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>