264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4804 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  100 
 
 
165 aa  342  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  98.79 
 
 
179 aa  338  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  98.79 
 
 
179 aa  338  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  98.79 
 
 
179 aa  338  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  98.79 
 
 
179 aa  338  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  98.18 
 
 
165 aa  335  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  97.58 
 
 
165 aa  331  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  33.33 
 
 
174 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  33.33 
 
 
174 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  33.33 
 
 
174 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  33.75 
 
 
176 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  33.55 
 
 
174 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  33.33 
 
 
174 aa  97.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  31.93 
 
 
185 aa  97.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  31.33 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  32.48 
 
 
185 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0988  fimbrial protein  32.47 
 
 
181 aa  95.5  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.991205  normal  0.0750747 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  37.5 
 
 
172 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  37.5 
 
 
172 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  37.5 
 
 
172 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  37.5 
 
 
172 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  32.7 
 
 
193 aa  94  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0589  fimbrial protein internal segment  35.1 
 
 
164 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0147243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0590  fimbrial protein internal segment  35.1 
 
 
164 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0238251  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0654  fimbrial protein internal segment  35.1 
 
 
164 aa  90.9  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.781355  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0597  fimbrial protein internal segment  35.1 
 
 
164 aa  90.9  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0916045 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  36.18 
 
 
172 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  31.93 
 
 
185 aa  90.5  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  31.93 
 
 
185 aa  90.5  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  34.62 
 
 
187 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  34.62 
 
 
187 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  35.22 
 
 
183 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  32.67 
 
 
170 aa  85.9  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  29.87 
 
 
187 aa  84  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  33.77 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  34.18 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  32.34 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  32.34 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2279  Fimbrial protein  33.33 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  34.81 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  33.11 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  32.34 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  32.45 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  32.34 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  31.33 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  29.22 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  29.22 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  31.33 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  31.33 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  29.22 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  29.22 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  29.22 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.71 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  31.71 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  32.45 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  32.34 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  31.71 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  32.45 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  32.45 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  31.71 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  31.71 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  32.45 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  31.71 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  31.71 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  33.33 
 
 
170 aa  80.5  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  33.33 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  32.45 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  33.56 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  31.71 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  33.33 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  31.87 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  31.87 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  31.87 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  32 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  32 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  32 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  33.57 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  32 
 
 
210 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  30.67 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  30.67 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  33.77 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  33.77 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  33.77 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1891  type 1 pili subunit FimI  31.36 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  31.17 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  28.76 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  30.59 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.85 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  27.85 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  28.76 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  27.85 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  27.85 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  27.85 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  28.76 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  26.83 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  29.75 
 
 
181 aa  67.4  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  29.7 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  30.12 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  29.45 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  29.45 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>