238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A1655 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  100 
 
 
210 aa  340  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  100 
 
 
170 aa  339  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  100 
 
 
170 aa  339  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  100 
 
 
170 aa  339  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  81.76 
 
 
170 aa  283  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  81.76 
 
 
170 aa  283  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  81.76 
 
 
170 aa  283  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  82.35 
 
 
170 aa  264  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  82.35 
 
 
170 aa  264  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  78.16 
 
 
174 aa  255  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  75.88 
 
 
170 aa  239  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  43.87 
 
 
173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  41.4 
 
 
184 aa  100  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  40.34 
 
 
174 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  41.83 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  37.14 
 
 
174 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  37.71 
 
 
174 aa  95.5  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  37.71 
 
 
174 aa  95.5  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  37.71 
 
 
174 aa  95.5  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  41.06 
 
 
187 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  41.06 
 
 
187 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  37.7 
 
 
183 aa  91.3  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  37.91 
 
 
185 aa  90.9  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  41.56 
 
 
182 aa  90.5  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  37.25 
 
 
185 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  36.67 
 
 
179 aa  89  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  37.25 
 
 
185 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  37.91 
 
 
187 aa  88.6  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  41.56 
 
 
182 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  41.56 
 
 
182 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  41.56 
 
 
182 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  35.23 
 
 
176 aa  87.4  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  35.23 
 
 
176 aa  87  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  35.23 
 
 
176 aa  87  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  35.23 
 
 
176 aa  87  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  35.23 
 
 
176 aa  87  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  38.31 
 
 
176 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  37.57 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  37.57 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  37.57 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  37.57 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  38.78 
 
 
172 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  36.36 
 
 
187 aa  84.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  37.91 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  37.91 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  32.67 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  37.5 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  32 
 
 
179 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  32 
 
 
179 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  32 
 
 
179 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  32 
 
 
179 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  32 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  32 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  34.64 
 
 
179 aa  77.4  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  34.64 
 
 
179 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  34.64 
 
 
179 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  34.64 
 
 
179 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  34.64 
 
 
179 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  32.4 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  32.77 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  33.51 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  33.51 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  33.51 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  33.51 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  35.95 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  33.51 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4675  fimbrial protein  29.12 
 
 
204 aa  71.2  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  35.29 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  35.29 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  35.29 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  35.29 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  35.29 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  35.29 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  34.59 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  35.29 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  31.85 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  31.79 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2230  type I pilus biogensis protein FimA  33.96 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  32 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  30.86 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  34.59 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  32.47 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3982  protein LpfE  34.25 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567222  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.96 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  30.29 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1053  fimbrial protein  32.22 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.165848  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  31.96 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2380  fimbrial protein  32.22 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3849  protein LpfE  31.28 
 
 
175 aa  63.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551931  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  32.95 
 
 
180 aa  63.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  33.77 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  33.77 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  33.77 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3624  fimbrial protein  33.51 
 
 
194 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.25 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03009  predicted fimbrial-like adhesin protein  33.51 
 
 
194 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  31.25 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0556  fimbrial protein  33.51 
 
 
194 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  31.25 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02960  hypothetical protein  33.51 
 
 
194 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>