96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2230 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2230  type I pilus biogensis protein FimA  100 
 
 		 183 aa  358  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2039  fimbrial protein  69.23 
 
 		 183 aa  239  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330404  normal  0.373612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1891  type 1 pili subunit FimI  51.67 
 
 		 179 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1501  fimbrial protein  37.57 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3824  fimbrial protein-like protein  38.38 
 
 		 208 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1466  fimbrial protein  41.14 
 
 		 158 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  38.92 
 
 		 193 aa  80.9  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  33.89 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  33.89 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  33.89 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  33.89 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  35.36 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  35.36 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  35.36 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  34.57 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  33.7 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  33.95 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  33.95 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  33.94 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  33.33 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  35.39 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  35.39 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  35.39 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  29.61 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  29.61 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  32.73 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  29.61 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  29.61 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  32.73 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  30.13 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  28.57 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  31.87 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  31.87 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  31.87 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  28.57 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  31.87 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  29.75 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  28.57 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  29.49 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  32.42 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  33.94 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  33.86 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  31.18 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  33.94 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  34.46 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  29.59 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  29.59 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  32.62 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  31.85 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4018  hypothetical protein  30.43 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3958  hypothetical protein  30.43 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3914  hypothetical protein  30.43 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  32.79 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  29.59 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  27.47 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3849  protein LpfE  32.09 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551931  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  32.53 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  32.53 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  32.53 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.93 
 
 		 171 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  32.53 
 
 		 170 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  32.53 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  32.53 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  31.93 
 
 		 171 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  32.53 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  29.44 
 
 		 171 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  29.44 
 
 		 171 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  29.44 
 
 		 171 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  30.38 
 
 		 168 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  30.38 
 
 		 168 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  32.7 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0402  fimbrial protein  29.63 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  30.27 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  30.27 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  30.27 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  30.27 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  28.28 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3927  putative fimbrial protein FanC  27.17 
 
 		 175 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.662552 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  30.69 
 
 		 181 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  31.11 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  31.11 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  30.27 
 
 		 176 aa  45.1  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  31.11 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  31.05 
 
 		 183 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  28.57 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3624  fimbrial protein  30.54 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  30.56 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11060  putative fimbrial subunit CupB1  32 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  32.65 
 
 		 182 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4917  protein LpfE  28.66 
 
 		 176 aa  42  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4460  putative type 1 fimbrial protein  30.54 
 
 		 194 aa  42  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3334  putative type 1 fimbrial protein  30.39 
 
 		 194 aa  41.2  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.370999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0556  fimbrial protein  30.39 
 
 		 194 aa  41.2  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02960  hypothetical protein  30.39 
 
 		 194 aa  41.2  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03009  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.39 
 
 		 194 aa  41.2  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0563  Fimbrial protein  29.56 
 
 		 194 aa  40.8  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>