67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1891 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1891  type 1 pili subunit FimI  100 
 
 		 179 aa  362  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2230  type I pilus biogensis protein FimA  53.21 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2039  fimbrial protein  47.46 
 
 		 183 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330404  normal  0.373612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3824  fimbrial protein-like protein  33.33 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1501  fimbrial protein  37.63 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  31.36 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  30.29 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  30.29 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  30.29 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  30.29 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  30.18 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  30.77 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  30.3 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1466  fimbrial protein  29.49 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  29.35 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  29.44 
 
 		 170 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  29.44 
 
 		 170 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  29.44 
 
 		 170 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  28.89 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  28.89 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  28.89 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  28.89 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  30 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  30 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  31.25 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  30.85 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  29.53 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  28.75 
 
 		 171 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  28.75 
 
 		 171 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  28.75 
 
 		 171 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  28.75 
 
 		 168 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  28.75 
 
 		 168 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  28.16 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  28.33 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  27.75 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  27.75 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  27.75 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  25.26 
 
 		 181 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  28.06 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3624  fimbrial protein  27.89 
 
 		 194 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  25.26 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  25.26 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4460  putative type 1 fimbrial protein  28.04 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  25.26 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  27.65 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  25.63 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  25.63 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  25.26 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  26.52 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  26.13 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03009  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.14 
 
 		 194 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02960  hypothetical protein  27.14 
 
 		 194 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0556  fimbrial protein  27.14 
 
 		 194 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3334  putative type 1 fimbrial protein  27.14 
 
 		 194 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.370999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11060  putative fimbrial subunit CupB1  28.25 
 
 		 189 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  29.73 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  24 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  25.14 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  29.73 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  23.98 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  29.73 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0563  Fimbrial protein  26.98 
 
 		 194 aa  42  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  29.48 
 
 		 180 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  24.07 
 
 		 187 aa  41.6  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  26.44 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  24.5 
 
 		 193 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  24.5 
 
 		 193 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>