73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2039 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2039  fimbrial protein  100 
 
 		 183 aa  362  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330404  normal  0.373612 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2230  type I pilus biogensis protein FimA  68.07 
 
 		 183 aa  217  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1891  type 1 pili subunit FimI  47.46 
 
 		 179 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1501  fimbrial protein  37.77 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3824  fimbrial protein-like protein  35.52 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1466  fimbrial protein  33.76 
 
 		 158 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  34.08 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  33.53 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  32.96 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  33.89 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  34.08 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  35.12 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  33.54 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  35.12 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  35.12 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  33.52 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  33.93 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  33.72 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  28.14 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  27.93 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  27.93 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  27.93 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  27.93 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  27.37 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  27.37 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.4 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  31.4 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  31.11 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  27.68 
 
 		 174 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.4 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  27.68 
 
 		 174 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  27.68 
 
 		 174 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  28.48 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  26.55 
 
 		 174 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  32.78 
 
 		 200 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3836  fimbrial protein-like protein  28.12 
 
 		 362 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38252  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  26.92 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11060  putative fimbrial subunit CupB1  29.94 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  27.95 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  31.29 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  26.58 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  26.58 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4144  fimbrial protein  27.59 
 
 		 222 aa  45.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  26.58 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  30.49 
 
 		 180 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  29.3 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  27.85 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.3 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  26.58 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  27.85 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  30.49 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.49 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  30.49 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  30.49 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  30.49 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  30.49 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  30.49 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  27.85 
 
 		 170 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  27.85 
 
 		 170 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  27.85 
 
 		 170 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  29.3 
 
 		 171 aa  44.3  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  29.3 
 
 		 171 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  29.3 
 
 		 171 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  28.75 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  28.75 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  28.75 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  30.08 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  28.75 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  29.78 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  29.78 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  29.78 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  29.78 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  29.78 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>