63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4144 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4144  fimbrial protein  100 
 
 		 222 aa  448  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4721  fimbrial protein  53.55 
 
 		 220 aa  208  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.687124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0405  fimbrial protein  41.36 
 
 		 195 aa  124  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4675  fimbrial protein  31.46 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  26.26 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  27.88 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  26.32 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  25.76 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  25.76 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  25.76 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0402  fimbrial protein  29.52 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  26.99 
 
 		 170 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  28.66 
 
 		 173 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  23.31 
 
 		 176 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  23.31 
 
 		 176 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  23.31 
 
 		 176 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  26.44 
 
 		 174 aa  52  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4107  fimbrial protein  26.11 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  23.49 
 
 		 165 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  21.76 
 
 		 168 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  21.76 
 
 		 168 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  21.76 
 
 		 171 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4167  fimbrial protein  26.51 
 
 		 185 aa  48.5  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208519 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  21.76 
 
 		 171 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  21.76 
 
 		 171 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0051  fimbrial protein  26.51 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  22.89 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  22.89 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  22.89 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  22.89 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  28.07 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0216  putative fimbrial subunit  22.22 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.17546  normal  0.944353 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  22.89 
 
 		 165 aa  47  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0214  putative fimbrial subunit  22.22 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  28.07 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  24.86 
 
 		 179 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  28.07 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.07 
 
 		 188 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0231  putative fimbrial subunit  22.22 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0232  putative fimbrial subunit  22.22 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2039  fimbrial protein  27.59 
 
 		 183 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330404  normal  0.373612 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3481  fimbrial protein  37.93 
 
 		 187 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  22.29 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  26.56 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  25.77 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  25.77 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  25.77 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  26.56 
 
 		 176 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  26.56 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  26.56 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  26.56 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  26.56 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  21.51 
 
 		 183 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  21.51 
 
 		 183 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  21.51 
 
 		 183 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  21.51 
 
 		 183 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  21.51 
 
 		 183 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  26.04 
 
 		 176 aa  42.4  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  22.51 
 
 		 183 aa  42.4  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  24.51 
 
 		 200 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  35.71 
 
 		 187 aa  41.6  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  35.71 
 
 		 187 aa  41.6  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  25.91 
 
 		 176 aa  41.6  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>