38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0405 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0405  fimbrial protein  100 
 
 
195 aa  401  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4144  fimbrial protein  41.36 
 
 
222 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370887  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4721  fimbrial protein  40 
 
 
220 aa  115  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.687124  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4675  fimbrial protein  28.99 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  26.7 
 
 
176 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  28.27 
 
 
174 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  24.24 
 
 
170 aa  51.6  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  26.7 
 
 
174 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  25.65 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  25.65 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  25.65 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  26.51 
 
 
179 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  27.07 
 
 
172 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  26.51 
 
 
179 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  26.51 
 
 
179 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  26.51 
 
 
179 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  26.51 
 
 
165 aa  48.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  26.32 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  26.32 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  26.32 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  26.32 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  25.9 
 
 
165 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  26.06 
 
 
170 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  26.06 
 
 
170 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  26.06 
 
 
170 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  25.9 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  25.13 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  25.14 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  25.14 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  25.14 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  25.7 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  25.14 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  25.14 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  24.58 
 
 
176 aa  42.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  24.38 
 
 
190 aa  42  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  24.38 
 
 
190 aa  42  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  24.38 
 
 
190 aa  42  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  24.02 
 
 
176 aa  41.6  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>