287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0029 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  100 
 
 		 172 aa  347  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  100 
 
 		 172 aa  347  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  100 
 
 		 172 aa  347  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  100 
 
 		 172 aa  347  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  98.26 
 
 		 172 aa  341  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  40.11 
 
 		 176 aa  114  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  39.08 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  39.55 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  39.55 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  39.55 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  39.55 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  39.55 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  38.98 
 
 		 176 aa  111  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  39.88 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  39.88 
 
 		 171 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  39.88 
 
 		 171 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  38.42 
 
 		 176 aa  110  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  40.48 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  40.48 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  39.08 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  39.29 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  39.29 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  41.77 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2279  Fimbrial protein  39.04 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  37.8 
 
 		 174 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  37.5 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  37.5 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  37.5 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  37.5 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  37.5 
 
 		 165 aa  95.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  37.5 
 
 		 165 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  36.84 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  38.36 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  34.84 
 
 		 174 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  34.19 
 
 		 174 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  34.19 
 
 		 174 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  34.19 
 
 		 174 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  37.25 
 
 		 176 aa  88.2  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  37.25 
 
 		 176 aa  88.2  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  37.25 
 
 		 176 aa  88.2  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  34.46 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  33.53 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  33.53 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  33.53 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  33.53 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  33.53 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  35.8 
 
 		 185 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  33.53 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  33.53 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  33.53 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  34.46 
 
 		 185 aa  85.5  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  36.42 
 
 		 176 aa  85.1  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  32.99 
 
 		 195 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  34.67 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  34.67 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  32.84 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  32.82 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  32.4 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  32.2 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  34.46 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  33.9 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  32.12 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  33.33 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  33.33 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  33.33 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167394 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  33.33 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  32.24 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  28.5 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  35.84 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  30 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  32.16 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4139  fimbrial protein  34.15 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  30 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  38.26 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  29.47 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  34.13 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0408  fimbrial protein  32.93 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  29.48 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  29.48 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  29.48 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  31.13 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  31.13 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  31.93 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  33.74 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  32.3 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  38.16 
 
 		 355 aa  68.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1068  fimbrial protein  30 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  30.73 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  30 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.17 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  30.17 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  30.17 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  30.17 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  30.17 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  34.19 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  34.19 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  34.19 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  34.19 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  34.19 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  34.19 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>