226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0027 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  100 
 
 		 171 aa  351  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  100 
 
 		 171 aa  351  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  100 
 
 		 171 aa  351  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  100 
 
 		 168 aa  345  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  100 
 
 		 168 aa  345  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00946  predicted fimbrial-like adhesin protein  43.51 
 
 		 180 aa  124  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.118713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2654  fimbrial protein  43.51 
 
 		 180 aa  124  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00417117  hitchhiker  0.00341593 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2701  Fimbrial protein  43.51 
 
 		 180 aa  124  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000889642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1105  fimbrial protein  43.79 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000686387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1051  fimbrial protein  43.51 
 
 		 180 aa  124  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00269088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1057  fimbrial protein  43.51 
 
 		 180 aa  124  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00953  hypothetical protein  43.51 
 
 		 180 aa  124  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116375  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2375  fimbrial protein  43.51 
 
 		 180 aa  124  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000301553  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2177  fimbrial protein  43.79 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000769116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  38.96 
 
 		 187 aa  98.2  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  35.53 
 
 		 176 aa  90.9  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  35.53 
 
 		 176 aa  90.9  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  35.53 
 
 		 176 aa  90.9  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  35.71 
 
 		 185 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  35.71 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  35.06 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  35.71 
 
 		 185 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  35.71 
 
 		 185 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  29.22 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  29.22 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  29.22 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  29.22 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  34.03 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  34.03 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  34.03 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  29.22 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  34.03 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  34.03 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  34.03 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  34.03 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  28.57 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  29.22 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  33.33 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  30.67 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.67 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  30.67 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  30.67 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  30.67 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  30.67 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  30.67 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  30.67 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  31.48 
 
 		 175 aa  73.9  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  31.82 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  30.06 
 
 		 172 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  32.68 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  34.86 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  29.48 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  29.48 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  29.48 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  29.48 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  33.77 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  33.77 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  33.77 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  33.77 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  33.77 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  33.77 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  33.77 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  33.77 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  30.72 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  31.58 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  30.72 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  30.72 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  30.57 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  30.07 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  33.12 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  32.05 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.29 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  28.29 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  28.29 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  30.97 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  28.29 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  28.29 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  31.37 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  31.37 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  29.27 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  30.67 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  29.27 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  27.91 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  31.37 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  30.67 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167394 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  30.67 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  30.67 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  30.67 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  30.72 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  32.58 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  28.66 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  30.72 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  31.06 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  33.76 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  29.61 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.61 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  29.61 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  29.61 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  29.61 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  30.32 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>