59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3481 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3481  fimbrial protein  100 
 
 
187 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1314  fimbrial protein  88.77 
 
 
187 aa  316  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02263  predicted fimbrial-like adhesin protein  88.77 
 
 
187 aa  314  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1318  Fimbrial protein  88.77 
 
 
187 aa  314  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2634  fimbrial protein  88.24 
 
 
187 aa  315  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02224  hypothetical protein  88.77 
 
 
187 aa  314  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2490  fimbrial protein  87.7 
 
 
187 aa  313  8e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2497  fimbrial protein  68.78 
 
 
188 aa  256  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0214  putative fimbrial subunit  39.29 
 
 
186 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0216  putative fimbrial subunit  39.29 
 
 
186 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.17546  normal  0.944353 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0232  putative fimbrial subunit  39.29 
 
 
186 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69001  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0231  putative fimbrial subunit  39.29 
 
 
186 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157233  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3088  putative fimbrial subunit  36.27 
 
 
195 aa  91.3  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3269  putative fimbrial subunit  36.27 
 
 
195 aa  91.3  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0251275 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3152  putative fimbrial subunit  36.27 
 
 
195 aa  91.3  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156636 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3171  putative fimbrial subunit  36.27 
 
 
195 aa  91.3  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.320855  normal  0.326781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  31.41 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  30.81 
 
 
187 aa  72  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  29.32 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  29.32 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  29.32 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.32 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  29.32 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  34.91 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  29.53 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  30.85 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  27.89 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  27.89 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  27.89 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  27.89 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  30.49 
 
 
176 aa  61.6  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  28.95 
 
 
176 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  32.17 
 
 
173 aa  58.5  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  40.24 
 
 
174 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  29.33 
 
 
195 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  29.05 
 
 
196 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  36.89 
 
 
174 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  36.89 
 
 
174 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  36.89 
 
 
174 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  29.61 
 
 
193 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  29.61 
 
 
193 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  28.22 
 
 
193 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4675  fimbrial protein  33.87 
 
 
204 aa  51.2  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  30.11 
 
 
174 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  26.63 
 
 
200 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4107  fimbrial protein  33.73 
 
 
185 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4139  fimbrial protein  25.79 
 
 
180 aa  48.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274717  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0051  fimbrial protein  35.06 
 
 
185 aa  47.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4167  fimbrial protein  35.06 
 
 
185 aa  47.8  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4717  fimbrial protein  23.58 
 
 
180 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0885059  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4144  fimbrial protein  37.93 
 
 
222 aa  45.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370887  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  29.73 
 
 
188 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  31.63 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4721  fimbrial protein  32.76 
 
 
220 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.687124  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  24.19 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0563  Fimbrial protein  37.35 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  25.47 
 
 
182 aa  42  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  28.32 
 
 
187 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4460  putative type 1 fimbrial protein  36.14 
 
 
194 aa  41.2  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>