86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2497 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2497  fimbrial protein  100 
 
 		 188 aa  387  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2634  fimbrial protein  69.84 
 
 		 187 aa  245  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02263  predicted fimbrial-like adhesin protein  69.31 
 
 		 187 aa  245  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02224  hypothetical protein  69.31 
 
 		 187 aa  245  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1318  Fimbrial protein  69.31 
 
 		 187 aa  245  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2490  fimbrial protein  69.31 
 
 		 187 aa  244  6.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1314  fimbrial protein  68.25 
 
 		 187 aa  241  5e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3481  fimbrial protein  68.78 
 
 		 187 aa  239  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0216  putative fimbrial subunit  42.2 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.17546  normal  0.944353 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0214  putative fimbrial subunit  42.2 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0232  putative fimbrial subunit  42.2 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69001  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0231  putative fimbrial subunit  42.2 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3088  putative fimbrial subunit  39.18 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3171  putative fimbrial subunit  39.18 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.320855  normal  0.326781 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3269  putative fimbrial subunit  39.18 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0251275 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3152  putative fimbrial subunit  39.18 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156636 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  29.08 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  30.73 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  30.16 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  28.66 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  32.49 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  32.49 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  32.49 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  32.49 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  31.98 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  33.33 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  28.49 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  33.33 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  33.33 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  33.33 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  33.33 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  35.58 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  35.64 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  35.64 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  35.64 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  31.34 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  31.44 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4675  fimbrial protein  21.67 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  31.44 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  41.67 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  30.77 
 
 		 193 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  34.48 
 
 		 174 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4107  fimbrial protein  30.68 
 
 		 185 aa  51.2  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4167  fimbrial protein  30.68 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208519 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0051  fimbrial protein  30.68 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  38.14 
 
 		 170 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  38.14 
 
 		 170 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  38.14 
 
 		 170 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  26.18 
 
 		 173 aa  48.5  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  29.36 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  29.36 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  29.36 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  29.36 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  29.36 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4721  fimbrial protein  24.09 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.687124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  30.14 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  32.39 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  32.39 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  32.39 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  32.39 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4717  fimbrial protein  32.93 
 
 		 180 aa  45.1  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0885059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4139  fimbrial protein  25.93 
 
 		 180 aa  44.7  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  28.26 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  33.33 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  28.26 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  28.26 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  28.26 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.26 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  33.85 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  28.26 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  28.3 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  33.33 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  38.37 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  28.26 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  28.3 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  28.26 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  24.86 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  28.26 
 
 		 171 aa  42  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0563  Fimbrial protein  36.14 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  23.6 
 
 		 188 aa  41.2  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  23.6 
 
 		 188 aa  41.2  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  26.98 
 
 		 179 aa  41.2  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  23.6 
 
 		 188 aa  41.2  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4460  putative type 1 fimbrial protein  36.14 
 
 		 194 aa  41.2  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  39.02 
 
 		 170 aa  41.2  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>