49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3171 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3171  putative fimbrial subunit  100 
 
 		 195 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.320855  normal  0.326781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3152  putative fimbrial subunit  100 
 
 		 195 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156636 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3088  putative fimbrial subunit  100 
 
 		 195 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3269  putative fimbrial subunit  100 
 
 		 195 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0251275 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0216  putative fimbrial subunit  45.86 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.17546  normal  0.944353 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0214  putative fimbrial subunit  45.86 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0231  putative fimbrial subunit  45.86 
 
 		 186 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0232  putative fimbrial subunit  45.86 
 
 		 186 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69001  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2497  fimbrial protein  41.03 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3481  fimbrial protein  35.75 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  36.36 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  36.08 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  36.08 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  36.08 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  36.08 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1314  fimbrial protein  37.31 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  36.08 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2490  fimbrial protein  36.79 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2634  fimbrial protein  36.79 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02263  predicted fimbrial-like adhesin protein  36.79 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1318  Fimbrial protein  36.79 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02224  hypothetical protein  36.79 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  32.81 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  32.99 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  34.54 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  33.33 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  29.65 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  27.66 
 
 		 180 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  27.66 
 
 		 180 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  27.66 
 
 		 180 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  27.66 
 
 		 180 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  27.37 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  28.12 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  33.7 
 
 		 174 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  37.33 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  33.7 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  33.7 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  27.18 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  33.7 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4167  fimbrial protein  25.69 
 
 		 185 aa  44.7  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208519 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0051  fimbrial protein  25.69 
 
 		 185 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  26.67 
 
 		 173 aa  45.1  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  26.67 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  26.67 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  26.67 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  26.67 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  26.67 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4107  fimbrial protein  26.37 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  40 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>