87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02263 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02263  predicted fimbrial-like adhesin protein  100 
 
 
187 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02224  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1318  Fimbrial protein  100 
 
 
187 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2490  fimbrial protein  98.4 
 
 
187 aa  374  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2634  fimbrial protein  98.93 
 
 
187 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1314  fimbrial protein  98.4 
 
 
187 aa  374  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3481  fimbrial protein  88.77 
 
 
187 aa  318  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2497  fimbrial protein  71.43 
 
 
188 aa  263  8e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0214  putative fimbrial subunit  37.57 
 
 
186 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0216  putative fimbrial subunit  37.57 
 
 
186 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.17546  normal  0.944353 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0232  putative fimbrial subunit  37.57 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69001  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0231  putative fimbrial subunit  37.57 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157233  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3088  putative fimbrial subunit  36.27 
 
 
195 aa  84.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3152  putative fimbrial subunit  36.27 
 
 
195 aa  84.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156636 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3171  putative fimbrial subunit  36.27 
 
 
195 aa  84.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.320855  normal  0.326781 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3269  putative fimbrial subunit  36.27 
 
 
195 aa  84.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0251275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  30.89 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  30.3 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  31.91 
 
 
177 aa  61.2  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  29.81 
 
 
195 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  32.08 
 
 
182 aa  58.9  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  28.42 
 
 
176 aa  58.2  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  28.42 
 
 
176 aa  58.2  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  28.42 
 
 
176 aa  58.2  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  28.42 
 
 
176 aa  58.2  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  28.42 
 
 
176 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  29.05 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  28.27 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  28.27 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  30.49 
 
 
176 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.27 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  28.27 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  28.27 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  27.75 
 
 
183 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  29.5 
 
 
193 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  29.5 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  29.57 
 
 
173 aa  52.4  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  28.87 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4675  fimbrial protein  33.78 
 
 
204 aa  51.6  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  26.84 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0563  Fimbrial protein  38.55 
 
 
194 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  31.36 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4460  putative type 1 fimbrial protein  37.35 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4717  fimbrial protein  27 
 
 
180 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0885059  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4139  fimbrial protein  25.79 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274717  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  28.07 
 
 
174 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  28.07 
 
 
174 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  28.07 
 
 
174 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  28.26 
 
 
179 aa  45.1  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3624  fimbrial protein  36.14 
 
 
194 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4721  fimbrial protein  32.76 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.687124  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  27.75 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  25.75 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03009  predicted fimbrial-like adhesin protein  36.14 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  25.75 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02960  hypothetical protein  36.14 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  25.75 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3334  putative type 1 fimbrial protein  36.14 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.370999  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  25.75 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4107  fimbrial protein  28.42 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0556  fimbrial protein  36.14 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  25.75 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  34.02 
 
 
170 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  25.75 
 
 
171 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0988  fimbrial protein  21.21 
 
 
181 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.991205  normal  0.0750747 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  25.75 
 
 
171 aa  42.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  34.02 
 
 
170 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  25.75 
 
 
187 aa  42.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  34.02 
 
 
170 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  35.71 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  35.71 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  35.71 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  27.92 
 
 
176 aa  42.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  25.75 
 
 
171 aa  42  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0051  fimbrial protein  28.42 
 
 
185 aa  42  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4167  fimbrial protein  28.42 
 
 
185 aa  42  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208519 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  24.19 
 
 
188 aa  41.6  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  27.27 
 
 
176 aa  41.6  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3093  fimbrial subunit  24.55 
 
 
178 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  35.71 
 
 
210 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  27.03 
 
 
188 aa  41.2  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  27.27 
 
 
200 aa  41.2  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  27.91 
 
 
180 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  27.91 
 
 
180 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  24.84 
 
 
182 aa  41.2  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  27.91 
 
 
180 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  27.91 
 
 
180 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>