175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3364 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  99.48 
 
 		 193 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  100 
 
 		 193 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  92.75 
 
 		 193 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  88.21 
 
 		 195 aa  346  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  86.22 
 
 		 196 aa  334  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4107  fimbrial protein  34.18 
 
 		 185 aa  88.2  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4167  fimbrial protein  33.67 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208519 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0051  fimbrial protein  33.67 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  33.33 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  33.33 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  33.33 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  35.15 
 
 		 176 aa  84.7  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  34.67 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  34.67 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  34.67 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  34.67 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  32.81 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  33.51 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  33.51 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  33.67 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  32.49 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  34.16 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  31.03 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  33.73 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.59 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  29.59 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  29.59 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  29.59 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  29.59 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  29.59 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  32.26 
 
 		 175 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  29.8 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  30.54 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  32.32 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  29.45 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  29.45 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  32.73 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  29.45 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  29.45 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  29.45 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  29.9 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  29.9 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  29.9 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  29.45 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  28.65 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  29.45 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4147  fimbrial protein  29.24 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  30.05 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  29.38 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  29.38 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  29.38 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  30.54 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.12 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  30.54 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0402  fimbrial protein  28.21 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  28.12 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  28.12 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  28.12 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.18 
 
 		 171 aa  62  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  27.18 
 
 		 171 aa  62  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  27.18 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  27.18 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  27.18 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  29.02 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  28.87 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  29.95 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  29.95 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  29.95 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  29.95 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  32.1 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  29.95 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  30.91 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  30.91 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  29.95 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  30.91 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  30.91 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  30.91 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  29.95 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  27.18 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  29.8 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  27.18 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2227  fimbrial protein, putative  25.36 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0719141  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  27.08 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  29.65 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  30.12 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  30.12 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  27.08 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  30.12 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  28.5 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  30.12 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  30.12 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  32.16 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0822  Fimbrial protein  27.61 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  32.16 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3042  fimbrial protein  30.92 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000700395  normal  0.254903 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1498  fimbrial protein  32.58 
 
 		 359 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  30.56 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4139  fimbrial protein  26.97 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1057  Fimbrial protein  26.42 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  26.67 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>