82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3042 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3042  fimbrial protein  100 
 
 		 195 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000700395  normal  0.254903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3753  fimbrial protein-like protein  55.8 
 
 		 199 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3809  Fimbrial protein  34.12 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00136767  normal  0.0813635 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3922  Fimbrial protein  34.12 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.422951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1312  fimbral biosynthesis protein  30.58 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.467009  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0761  Fimbrial protein  37.57 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.977833  normal  0.0148789 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0830  Fimbrial protein  35.43 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  34.68 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4408  fimbrial subunit CupC1  31.13 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1131  fimbrial protein  29.61 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0729525 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4005  hypothetical protein  31.9 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51470  fimbrial subunit CupC1  30.92 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00125924  hitchhiker  0.000154945 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  31 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  32.04 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  34.15 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  31.55 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  27.23 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3290  fimbrial protein  32.43 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0324288 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  33.33 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  33.33 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  30.92 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  28.86 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  30.92 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  30.43 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  32.56 
 
 		 176 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  31.87 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11060  putative fimbrial subunit CupB1  29.41 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  27.41 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  27.92 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  27.14 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  29.67 
 
 		 170 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  29.21 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  27.92 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  30.53 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  30.77 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  27.94 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  29.67 
 
 		 170 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  29.67 
 
 		 170 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  29.48 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  29.51 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  29.51 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  29.51 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  28.74 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  28.71 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  28.71 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  28.71 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  28.71 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  31.63 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  31.63 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  31.63 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  31.63 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  30.85 
 
 		 172 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  31.55 
 
 		 182 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  31.63 
 
 		 176 aa  48.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1532  fimbrial protein  28.36 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.690066 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  28.79 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  28.28 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  27.55 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  28.28 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  27.98 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  28.28 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  27.38 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  29.73 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  29.73 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  29.73 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  29.73 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  26.74 
 
 		 175 aa  45.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  27.84 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  27.84 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  28.82 
 
 		 170 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  28.82 
 
 		 170 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  27.62 
 
 		 165 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  32.93 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  29.35 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  31.29 
 
 		 184 aa  42.4  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  31.58 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  27.87 
 
 		 177 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  29.44 
 
 		 183 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  28.28 
 
 		 184 aa  42  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30690  hypothetical protein  27.78 
 
 		 351 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000866279  hitchhiker  0.000842933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3836  fimbrial protein-like protein  31.36 
 
 		 362 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38252  normal  0.631566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>