64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_51470 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_51470  fimbrial subunit CupC1  100 
 
 		 205 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00125924  hitchhiker  0.000154945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4408  fimbrial subunit CupC1  64.08 
 
 		 203 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3290  fimbrial protein  58.89 
 
 		 197 aa  177  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0324288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3042  fimbrial protein  32.39 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000700395  normal  0.254903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1312  fimbral biosynthesis protein  30.77 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.467009  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1131  fimbrial protein  29.12 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0729525 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  35.52 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  32.41 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.8 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  31.8 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  32.39 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  31.35 
 
 		 175 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  30 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3753  fimbrial protein-like protein  36.76 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3809  Fimbrial protein  31.31 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00136767  normal  0.0813635 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3922  Fimbrial protein  31.31 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.422951 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  30.15 
 
 		 176 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0830  Fimbrial protein  32.63 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2448  fimbrial protein  27.62 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  29.13 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  27.54 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  27.94 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  29.84 
 
 		 172 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  29.84 
 
 		 172 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  29.84 
 
 		 172 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  29.84 
 
 		 172 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.54 
 
 		 183 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  31.54 
 
 		 183 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  31.54 
 
 		 183 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  31.54 
 
 		 183 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  31.54 
 
 		 183 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  31.54 
 
 		 183 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  30.14 
 
 		 180 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  29.32 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0209  pilin chaperone ecpD2  28.97 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  31.6 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11060  putative fimbrial subunit CupB1  31.6 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1498  fimbrial protein  26.82 
 
 		 359 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3836  fimbrial protein-like protein  30.77 
 
 		 362 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38252  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  27.59 
 
 		 174 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  27.59 
 
 		 174 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  27.59 
 
 		 174 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  33.61 
 
 		 184 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  30.26 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  28.02 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  29.27 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  30 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4153  fimbrial protein  27.94 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0761  Fimbrial protein  32.09 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.977833  normal  0.0148789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  29.85 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  26.37 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  26.37 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  23.41 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  29.85 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  29.85 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  27.23 
 
 		 176 aa  42.4  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  27.23 
 
 		 176 aa  42.4  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  28.44 
 
 		 187 aa  42.4  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  27.23 
 
 		 176 aa  42.4  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  27.23 
 
 		 176 aa  42.4  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  28.37 
 
 		 186 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0010  Fimbrial protein  28.12 
 
 		 319 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  28.57 
 
 		 182 aa  41.6  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  26.73 
 
 		 176 aa  41.2  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>