22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1131 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1131  fimbrial protein  100 
 
 		 194 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0729525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1312  fimbral biosynthesis protein  93.3 
 
 		 194 aa  360  9e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.467009  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3290  fimbrial protein  36.99 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0324288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3042  fimbrial protein  29.61 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000700395  normal  0.254903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4408  fimbrial subunit CupC1  31.38 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3922  Fimbrial protein  30.89 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.422951 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3809  Fimbrial protein  30.89 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00136767  normal  0.0813635 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3753  fimbrial protein-like protein  32.77 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51470  fimbrial subunit CupC1  26.83 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00125924  hitchhiker  0.000154945 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  26.29 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  26.29 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  26.29 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  26.29 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  26.29 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  27.27 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  27.27 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0761  Fimbrial protein  28.89 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.977833  normal  0.0148789 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  24.27 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0830  Fimbrial protein  29.67 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  24.26 
 
 		 193 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  28.89 
 
 		 170 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  29.41 
 
 		 184 aa  41.2  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>